 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 2/1 | 返回列表 |
| 查看: 3436 | 回復(fù): 41 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
jianqin金蟲 (正式寫手)
|
[求助]
Gaussian幾何優(yōu)化后的鍵長(zhǎng)不合理
|
|
|
用Gaussian 09做分子幾何優(yōu)化。分子的部分結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖1，具有兩個(gè)手性中心（C3和C6）。幾何優(yōu)化分步過(guò)程如下：先用chem3D MM2做初步優(yōu)化，再用PM3優(yōu)化（包括頻率分析），接下來(lái)用RHF 6-31G做優(yōu)化（包括頻率分析），計(jì)算均成功完成。但是分子中的碳硫鍵C3-S1（圖1），經(jīng)PM3優(yōu)化后，鍵長(zhǎng)1.882埃，基本合理，經(jīng)RHF 6-31G優(yōu)化后竟然變成3.172埃，顯然是不合理的。我的疑問(wèn)如下： 我的這種分步優(yōu)化應(yīng)該是合理的吧？ 鍵長(zhǎng)不合理的情況是否與分子中包含手性中心有關(guān)？因?yàn)镃3是手性的，導(dǎo)致gaussian對(duì)碳硫鍵的處理不合理？（另一個(gè)手性中心C6周圍的鍵長(zhǎng)均在合理范圍內(nèi)） gaussian中對(duì)手性分子的幾何優(yōu)化有什么需要特別注意的嗎？ 6-31G的基組對(duì)于處理硫這樣的原子足夠嗎？ 補(bǔ)充：剛看到其他的帖子，認(rèn)為初始分子的構(gòu)型是否合理，對(duì)找到正確的優(yōu)化結(jié)構(gòu)很關(guān)鍵？那么我的分步優(yōu)化產(chǎn)生的構(gòu)型是否是比較合理的構(gòu)型呢？ [ Last edited by jianqin on 2011-7-15 at 09:40 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
PbS量子點(diǎn)紫外吸收
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求標(biāo)準(zhǔn)卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有88人回復(fù)
-
比利時(shí)魯汶大學(xué)與國(guó)家留學(xué)基金委共同資助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
量子點(diǎn)電致發(fā)光器件（QLED）：藍(lán)光量子點(diǎn)（QDs）和納米氧化鋅電子傳輸材料
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
需要一個(gè)圓偏振光誘導(dǎo)化學(xué)反應(yīng)，請(qǐng)問(wèn)使用圓偏振光作為光源，應(yīng)該需要哪些設(shè)備搭建
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
倫敦大學(xué)學(xué)院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光譜、催化相關(guān)26年博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
中國(guó)科學(xué)院成都山地災(zāi)害與環(huán)境研究所2026年特別研究助理（博士后）招聘啟事
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求ENDNOTE破解軟件安裝包
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
河海大學(xué) （211.雙一流高校）鈣鈦礦光電實(shí)驗(yàn)室丁勇團(tuán)隊(duì)歡迎有志青年！
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
黑龍江省原子能研究院化學(xué)課題組招收2026級(jí)化學(xué)專業(yè)或化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士生
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
zhangmt
至尊木蟲 (著名寫手)
我叫MT
- QC強(qiáng)帖: 5
- 應(yīng)助: 99 (初中生)
- 金幣: 6961.8
- 散金: 10406
- 紅花: 49
- 帖子: 1761
- 在線: 763.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 880392
- 注冊(cè): 2009-10-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
20樓2011-07-18 12:17:53
fatpig8832
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 7420.2
- 散金: 31
- 紅花: 28
- 帖子: 1438
- 在線: 610.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 770403
- 注冊(cè): 2009-05-14
2樓2011-07-15 10:20:09
jianqin
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 7 (幼兒園)
- 金幣: 3729.9
- 紅花: 2
- 帖子: 627
- 在線: 394小時(shí)
- 蟲號(hào): 863555
- 注冊(cè): 2009-10-05
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
3樓2011-07-15 10:33:52
fatpig8832
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 7420.2
- 散金: 31
- 紅花: 28
- 帖子: 1438
- 在線: 610.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 770403
- 注冊(cè): 2009-05-14
4樓2011-07-15 12:00:35
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料工程專碩274一志愿211求調(diào)劑 +6 | 薛云鵬 2026-03-15 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +7 | 邱gl 2026-03-11 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +5 | 26研0 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢(mèng)微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中科大材料與化工319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +4 | 這么名字咋樣 2026-03-14 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 學(xué)碩285求調(diào)劑 +13 | Wisjxn 2026-03-12 | 46/2300 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +4 | 學(xué)員97LZgn 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +6 | 邱gl 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 +5 | 隔壁陳先生 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，材料專碩317求調(diào)劑 +5 | lx8568 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 四川大學(xué)085601材料工程專碩 初試294求調(diào)劑 +4 | 祝我們好在冬天 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 球球古力 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +8 | 困于星晨 2026-03-12 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 工科調(diào)劑 +4 | Jiang191123！ 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 328化工專碩求調(diào)劑 +4 | 。，。，。，。i 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調(diào)劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 420求調(diào)劑 +4 | 莫向外求11 2026-03-10 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +5 | 呵唔哦豁 2026-03-10 | 5/250 |
|