 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 4/1 | 返回列表 |
| 查看: 3439 | 回復: 41 | ||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
jianqin金蟲 (正式寫手)
|
[求助]
Gaussian幾何優(yōu)化后的鍵長不合理
|
|
|
用Gaussian 09做分子幾何優(yōu)化。分子的部分結(jié)構(gòu)見圖1，具有兩個手性中心（C3和C6）。幾何優(yōu)化分步過程如下：先用chem3D MM2做初步優(yōu)化，再用PM3優(yōu)化（包括頻率分析），接下來用RHF 6-31G做優(yōu)化（包括頻率分析），計算均成功完成。但是分子中的碳硫鍵C3-S1（圖1），經(jīng)PM3優(yōu)化后，鍵長1.882埃，基本合理，經(jīng)RHF 6-31G優(yōu)化后竟然變成3.172埃，顯然是不合理的。我的疑問如下： 我的這種分步優(yōu)化應該是合理的吧？ 鍵長不合理的情況是否與分子中包含手性中心有關(guān)？因為C3是手性的，導致gaussian對碳硫鍵的處理不合理？（另一個手性中心C6周圍的鍵長均在合理范圍內(nèi)） gaussian中對手性分子的幾何優(yōu)化有什么需要特別注意的嗎？ 6-31G的基組對于處理硫這樣的原子足夠嗎？ 補充：剛看到其他的帖子，認為初始分子的構(gòu)型是否合理，對找到正確的優(yōu)化結(jié)構(gòu)很關(guān)鍵？那么我的分步優(yōu)化產(chǎn)生的構(gòu)型是否是比較合理的構(gòu)型呢？ [ Last edited by jianqin on 2011-7-15 at 09:40 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
求助立方晶體In(OH)3的CIF卡片
已經(jīng)有2人回復
-
CSC訪學博后項目獲批，外方學校暫停合作該怎么辦？
已經(jīng)有51人回復
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有249人回復
-
七嗪類物質(zhì)合成求助
已經(jīng)有0人回復
-
[電子教材]天津大學物理化學（第七版）上、下冊
已經(jīng)有3人回復
-
陰離子交換膜電解二氧化碳還原
已經(jīng)有0人回復
-
分子動力學模擬合作需求
已經(jīng)有2人回復
-
九江學院2026年最新高層次人才招聘公告
已經(jīng)有0人回復
-
深圳信息職業(yè)技術(shù)學院2026年教師招聘公告（最新）
已經(jīng)有0人回復
-
研究生招生
已經(jīng)有0人回復
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
zhangmt
至尊木蟲 (著名寫手)
我叫MT
- QC強帖: 5
- 應助: 99 (初中生)
- 金幣: 6961.8
- 散金: 10406
- 紅花: 49
- 帖子: 1761
- 在線: 763.2小時
- 蟲號: 880392
- 注冊: 2009-10-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
34樓2011-07-23 20:03:56
fatpig8832
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應助: 16 (小學生)
- 金幣: 7420.2
- 散金: 31
- 紅花: 28
- 帖子: 1438
- 在線: 610.9小時
- 蟲號: 770403
- 注冊: 2009-05-14
2樓2011-07-15 10:20:09
jianqin
金蟲 (正式寫手)
- 應助: 7 (幼兒園)
- 金幣: 3729.9
- 紅花: 2
- 帖子: 627
- 在線: 394小時
- 蟲號: 863555
- 注冊: 2009-10-05
- 專業(yè): 質(zhì)譜分析
3樓2011-07-15 10:33:52
fatpig8832
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應助: 16 (小學生)
- 金幣: 7420.2
- 散金: 31
- 紅花: 28
- 帖子: 1438
- 在線: 610.9小時
- 蟲號: 770403
- 注冊: 2009-05-14
4樓2011-07-15 12:00:35
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +4 | yy要上岸呀 2026-03-17 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +4 | 大口吃飯 身體健 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
[碩博家園] 湖北工業(yè)大學 生命科學與健康學院-課題組招收2026級食品/生物方向碩士 +3 | 1喜春8 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研化學學碩調(diào)劑，一志愿985 +4 | 張vvvv 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085601求調(diào)劑 +4 | Du.11 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085601專碩，總分342求調(diào)劑，地區(qū)不限 +3 | share_joy 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[論文投稿] 有沒有大佬發(fā)小論文能帶我個二作 +3 | 增銳漏人 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中科院材料273求調(diào)劑 +4 | yzydy 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 337一志愿華南理工0805材料求調(diào)劑 +7 | mysdl 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工301求調(diào)劑 +5 | 奕束光 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學一志愿211 總分320求調(diào)劑 +5 | 瑪卡巴卡啊哈 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +9 | 小羊小羊_ 2026-03-11 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 材料與化工085600調(diào)劑求老師收留 +9 | jiaanl 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 材料工程調(diào)劑 +4 | 咪咪空空 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 工科調(diào)劑 +4 | Jiang191123！ 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856化學工程280分求調(diào)劑 +4 | shenzxsn 2026-03-11 | 4/200 |
|