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dhd997榮譽(yù)版主 (文壇精英)
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[交流]
分子生物版之電泳專題-重金獎(jiǎng)勵(lì) 已有45人參與
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我們學(xué)生物的會(huì)遇到很多電泳的問(wèn)題，瓊脂糖，SDS-PAGE等等。 開(kāi)本帖的目的就是希望蟲(chóng)友們能把遇到的各種電泳，電泳試驗(yàn)方案，試驗(yàn)中遇到的問(wèn)題以及解決方案，小經(jīng)驗(yàn)，小總結(jié)分享出來(lái)。達(dá)到資源共享。 講訴范圍不限，只要是關(guān)于電泳的，電泳液，pH，電壓，膠的制備等等各個(gè)方面都可以。最好是自己親身經(jīng)歷的。 獎(jiǎng)勵(lì)措施：只要合理獎(jiǎng)勵(lì)5-50金幣，EPI不等。 電泳試驗(yàn)方案列出一般獎(jiǎng)勵(lì)不多，方案一般都統(tǒng)一化了。對(duì)于試驗(yàn)中遇到的問(wèn)題以及解決方案，小經(jīng)驗(yàn)，小總結(jié)的分享，會(huì)重金獎(jiǎng)勵(lì)  歡迎大家積極參與。本活動(dòng)的目的：當(dāng)蟲(chóng)友遇到電泳問(wèn)題的時(shí)候，希望只要看這一個(gè)帖子就可以解決問(wèn)題。 [ Last edited by dhd997 on 2011-8-28 at 09:59 ] |
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1949stone
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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
amisking(金幣+3, MolEPI+1): good！ 2011-08-21 19:46:02
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
amisking(金幣+3, MolEPI+1): good！ 2011-08-21 19:46:02
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同學(xué)分享給我 我再次分享 準(zhǔn)備干凈的配膠板和電泳槽 注意DNA酶污染的儀器可能會(huì)降解DNA，造成條帶信號(hào)弱、模糊甚至缺失的現(xiàn)象。 選擇電泳方法 一般的核酸檢測(cè)只需要瓊脂糖凝膠電泳就可以；如果需要分辨率高的電泳，特別是只有幾個(gè)bp的差別應(yīng)該選擇聚丙烯酰胺凝膠電泳；用普通電泳不合適的巨大DNA鏈應(yīng)該使用脈沖凝膠電泳。注意巨大DNA鏈用普通電泳可能跑不出膠孔導(dǎo)致缺帶。 正確選擇凝膠濃度 對(duì)于瓊脂糖凝膠電泳，濃度通常在0.5～2％之間，低濃度的用來(lái)進(jìn)行大片段核酸的電泳，高濃度的用來(lái)進(jìn)行小片段分析。低濃度膠易碎，小心操作和使用質(zhì)量好的瓊脂糖是解決辦法。注意高濃度的膠可能使分子大小相DNA帶不易分辨，造成條帶缺失現(xiàn)象。 適合的電泳緩沖液 常用的緩沖液有TAE和TBE，而TBE比TAE有著更好的緩沖能力。電泳時(shí)使用新制的緩沖液可以明顯提高電泳效果。注意電泳緩沖液多次使用后，離子強(qiáng)度降低，PH值上升，緩沖性能下降，可能使DNA電泳產(chǎn)生條帶模糊和不規(guī)則的DNA帶遷移的現(xiàn)象。 電泳的合適電壓和溫度 電泳時(shí)電壓不應(yīng)該超過(guò)20V/cm，電泳溫度應(yīng)該低于30℃，對(duì)于巨大的DNA電泳，溫度應(yīng)該低于15℃。注意如果電泳時(shí)電壓和溫度過(guò)高，可能導(dǎo)致出現(xiàn)條帶模糊和不規(guī)則的DNA帶遷移的現(xiàn)象。特別是電壓太大可能導(dǎo)致小片段跑出膠而出現(xiàn)缺帶現(xiàn)象。 DNA樣品的純度和狀態(tài) 注意樣品中含鹽量太高和含雜質(zhì)蛋白均可以產(chǎn)生條帶模糊和條帶缺失的現(xiàn)象。乙醇沉淀可以去除多余的鹽，用酚可以去除蛋白。注意變性的NA樣品可能導(dǎo)致條帶模糊和缺失，也可能出現(xiàn)不規(guī)則的DNA條帶遷移。在上樣前不要對(duì)DNA樣品加熱，用20mM NaCl緩沖液稀釋可以防止DNA變性。 DNA的上樣 正確的DNA上樣量是條帶清晰的保證。注意太多的DNA上樣量可能導(dǎo)致DNA帶型模糊，而太小的DNA上樣量則導(dǎo)致帶信號(hào)弱甚至缺失。TIANGEN公司DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)每次上樣6ul即可得到清晰均勻的條帶。 Marker的選擇 DNA電泳一定要使用DNA Marker或已知大小的正對(duì)照DNA來(lái)估計(jì)DNA片段大小。Marker應(yīng)該選擇在目標(biāo)片段大小附近ladder較密的，這樣對(duì)目標(biāo)片段大小的估計(jì)才比較準(zhǔn)確。TIANGEN公司的DNA Marker條帶清晰，亮度均勻，質(zhì)量穩(wěn)定，是您實(shí)驗(yàn)的首選。需要注意的是Marker的電泳同樣也要符合DNA電泳的操作標(biāo)準(zhǔn)。如果選擇λDNA/HindIII或者λDNA/EcoRI的酶切Marker，需要預(yù)先65℃加熱5min，冰上冷卻后使用。從而避免HindIII或EcoRI酶切造成的粘性接頭導(dǎo)致的片段連接不規(guī)則或條帶信號(hào)弱等現(xiàn)象。 凝膠的染色和觀察 實(shí)驗(yàn)室常用的核酸染色劑是溴化乙啶（EB），染色效果好，操作方便，但是穩(wěn)定性差，具有毒性。而其他系列例如SYBR Green，GelRed，雖然毒性小，但價(jià)格昂貴。TIANGEN公司的GeneGreen相比則是性價(jià)比高的低毒替代染料，其靈敏度比傳統(tǒng)EB染料高10倍以上。注意觀察凝膠時(shí)應(yīng)根據(jù)染料不同使用合適的光源和激發(fā)波長(zhǎng)，如果激發(fā)波長(zhǎng)不對(duì)，條帶則不易觀察，出現(xiàn)條帶模糊的現(xiàn)象。 [ Last edited by 1949stone on 2011-8-21 at 16:51 ] |
5樓2011-08-21 16:48:21
1949stone
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2樓2011-08-21 13:20:48
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fdfbox3樓2011-08-21 13:21:32
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dhd997(金幣+1): 來(lái)點(diǎn)實(shí)在的。不嫌說(shuō)的多 2011-08-21 16:39:46
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
dhd997(金幣+1): 來(lái)點(diǎn)實(shí)在的。不嫌說(shuō)的多 2011-08-21 16:39:46
| 好帖，必須頂。。。 |
4樓2011-08-21 16:27:47
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