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天鳥(niǎo)木蟲(chóng) (正式寫手)
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[交流]
DGGE引物，real-time PCR引物和 clone library引物 的轉(zhuǎn)化問(wèn)題 已有5人參與
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DGGE引物，real-time PCR引物和clone library引物 可以相互轉(zhuǎn)化著用嗎？ 假如我從環(huán)境中提取出了總DNA后，我想主要做DGGE的，但是很多文獻(xiàn)只有real-time PCR引物和clone library引物，我可以那這些引物，直接接上GC夾來(lái)擴(kuò)展該基因嗎？ |
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老夏853
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2樓2011-10-21 23:56:52
天鳥(niǎo)
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4樓2011-10-25 09:23:44
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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
zhang8826857(金幣+1): 鼓勵(lì)積極回帖^_^ 2011-10-25 10:15:48
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
zhang8826857(金幣+1): 鼓勵(lì)積極回帖^_^ 2011-10-25 10:15:48
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1. DGGE的片斷長(zhǎng)度一般小于600bp，常用的V3區(qū)引物擴(kuò)增片斷接近200bp，但是短片段造成分類信息不準(zhǔn)確，而且一般不能用于建樹(shù)。 2. clone文庫(kù)一般用于分析16S rDNA全長(zhǎng) 3. 定量PCR產(chǎn)物片斷一般小于200bp 4. 只有DGGE用GC夾子，高GC含量導(dǎo)致測(cè)序失敗。 |
5樓2011-10-25 10:14:47
天鳥(niǎo)
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6樓2011-10-25 11:12:51
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9樓2011-11-05 09:17:05
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