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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 微生物 » 實驗/技術 » PCR-DGGE的引物設計
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石城之子木蟲 (正式寫手)
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[求助]
PCR-DGGE的引物設計
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| 求助環(huán)境中分析真菌、細菌、放線菌多樣性和種群結構時，采用PCR-DGGE分析時的引物，最好是巢式PCR的引物對。拜謝！ |
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5樓2012-07-22 18:57:51
xiadongliang
金蟲 (正式寫手)
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【答案】應助回帖
★
感謝參與，應助指數(shù) +1
zhang8826857(金幣+1): 鼓勵應助 2011-12-12 15:15:17
石城之子(金幣+15): 能否給出相關文獻，拜謝！ 2011-12-12 23:19:00
感謝參與，應助指數(shù) +1
zhang8826857(金幣+1): 鼓勵應助 2011-12-12 15:15:17
石城之子(金幣+15): 能否給出相關文獻，拜謝！ 2011-12-12 23:19:00
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這都是通用引物。（免費贈送，哈哈） 細菌16S rDNA V3 region 194 bp 338F：5-CCT ACG GGA GGC AGC AG-3 518 R：5-ATT ACC GCG GCT GCT GG-3 GC338F：5-CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGGCGGGGCGGGGGCGCGGGGGG CCT ACG GGA GGC AGC AG-3 8%凝膠35%-55% 200V 電泳3 h 真菌18S rDNA 340 bp FR1：5-AIC CAT TCA ATC GGT AIT-3 FF390：5-CGA TAA CGA ACG AGA CCT-3 FR1：5-CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGGCGGGGCGGGGGCGCGGGGGG AIC CAT TCA ATC GGT AIT-3 200V 電泳4 h 6%凝膠35%-55% 放線菌 270 bp F243：5- GGA TGA GCC CGC GGC CTA-3 R513：5- CGG CCG CGG CTG CTG GCA CGT A-3 R513：5-CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGGCGGGGCGGGGGCGCGGGGGG CGG CCG CGG CTG CTG GCA CGT A-3 6%凝膠35%-55% 200V 電泳3.5 h |
2樓2011-12-12 14:29:04
琪瑤兒
金蟲 (小有名氣)
- 應助: 1 (幼兒園)
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- 專業(yè): 環(huán)境微生物學
【答案】應助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
zhang8826857(金幣+3): 鼓勵新蟲 2011-12-12 15:15:24
石城之子(金幣+5): 謝謝了啊，能否給我源文獻。拜謝��！ 2011-12-12 23:20:04
感謝參與，應助指數(shù) +1
zhang8826857(金幣+3): 鼓勵新蟲 2011-12-12 15:15:24
石城之子(金幣+5): 謝謝了啊，能否給我源文獻。拜謝��！ 2011-12-12 23:20:04
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Outer PCR 引物：CA/CT 簡并位點 正向引物8f為(5′-ggA gAg TTT gAT CA/CT ggC T-3′) 20bp 反向引物798r為( 5′-CCA ggg TAT CTA ATC CTg TT -3′) 20bp Inner PCR 引物： 341F-GC (5′-cgc ccg ccg cgc gcg gcg ggc ggg gcg ggg gca cgg ggg gCC TAC gCg Agg CAg CAg-3′) 57bp 534R (5′-ATT ACC gCg gCT gCT gg-3′) 17bp 我用過這個 |
3樓2011-12-12 14:56:40
6樓2017-08-18 15:34:41
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