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yesucao木蟲 (正式寫手)
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[求助]
實時定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線
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最近在做實時熒光定量PCR,做出來的標(biāo)準(zhǔn)曲線R2=0.992,但是計算的擴(kuò)增效率很高,120%(90-105%正常),這樣的標(biāo)準(zhǔn)曲線估計是不能用于下一步的計算中,想請問一下大蝦們:擴(kuò)增效率高的原因是什么??怎么避免過高的擴(kuò)增效率?? 接下來的實驗是要重新設(shè)計引物嗎? |
金蟲 (著名寫手)
| 擴(kuò)增效率高,說明你體系里可能有目的基因的抑制劑。但我感覺多半是你基因本身的問題,你可以多做幾次。其實擴(kuò)增效率120%是可以接受的,系統(tǒng)誤差的稍微變化都可能是這個結(jié)果,樓主不必?fù)?dān)心 |
銅蟲 (小有名氣)
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擴(kuò)增效率是用來形容引物和模板結(jié)合及pcr反應(yīng)的效率的。是反應(yīng)本身的特質(zhì)。 PCR擴(kuò)增效率比理論值偏高,大多是由于反應(yīng)體系中含有PCR阻害物質(zhì),需要改進(jìn)模板提取方法。另外,使用SYBR Green I嵌合熒光法檢測時,有時非特異性擴(kuò)增也會導(dǎo)致PCR擴(kuò)增效率高,要通過融解曲線分析加以確認(rèn)。 有可能你的引物設(shè)計有問題,需要重新設(shè)計。我們實驗室打算提取小鼠血樣中的DNA做后續(xù)的BIODAI SYBR Green 熒光定量PCR,SYBR染料法需要同時看線性圖譜的CT值和溶解曲線是否是單峰 |
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