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cfmzxf84木蟲 (正式寫手)
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[求助]
求助，已有PDB結(jié)構(gòu)的DS同源建模步驟，謝謝
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求助，我想用DS同源建模，已有多個PDB模板可以用，請教怎么操作呢？ 網(wǎng)上的教程基本上都是需要n95，或者90數(shù)據(jù)庫，從網(wǎng)上download結(jié)構(gòu)。 我有自己的模版，因此改變了一些步驟來做，但是一直不成功，求指導(dǎo)。謝謝 |
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cfmzxf84
木蟲 (正式寫手)
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8樓2012-03-20 09:09:13
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
jiaoyixiong: 金幣+3, 鼓勵交流 2012-03-17 19:49:58
cfmzxf84: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝 2012-03-18 00:16:03
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cfmzxf84: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝 2012-03-18 00:16:03
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首先把你要建模的目標(biāo)序列編譯成fasta文件 然后打開編好的fasta文件接著打開你要當(dāng)做模板的pdb文件 接下來在protocol里找到align sequence to template模塊，分別放入你的序列文件和pdb文件，修改相應(yīng)參數(shù) 計算完成后打開運行結(jié)果然后運行build homology modle放入相應(yīng)的文件進(jìn)行運算就ok了。 |
2樓2012-03-17 19:43:10
cfmzxf84
木蟲 (正式寫手)
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3樓2012-03-18 00:17:52
4樓2012-03-18 08:10:05
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