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| 本帖產(chǎn)生 1 個 MolEPI ,點擊這里進行查看 | ||||
h411470316鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
瓊脂糖電泳沒有條帶,但是DNA濃度很高,1000+ng/ul maker有條帶
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| Sample Text本人最近幾次PCR產(chǎn)物跑膠總是沒條帶,操作和以往經(jīng)驗一樣,用1%的TBE瓊脂糖凝膠電泳,跑25分鐘左右,但是一直都沒有條帶,maker可以正常跑出,目的片段是750bp左右的片段,換了人操作,結(jié)果也是一樣,但是測PCR產(chǎn)物DNA濃度的時候又有約1000+ng/ul,這是什么情況啊,求各位高人分析指點,小弟不甚感激。! |
分子生物 | 【分子生物】EPI帖 |
金蟲 (正式寫手)
琴美喜歡發(fā)呆 不喜歡發(fā)脾氣
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嗯..................... 說實話,你這個操作是個失誤哦,你測PCR產(chǎn)物是通過分光光度法測定的嗎?如果是,絕對不能這么操作的啊,原因有以下: 1. 你如何調(diào)Blank,PCR體系混雜,難道你要再配一管沒模板的PCR混合液去調(diào)Blank的嗎? 2. PCR都是成指數(shù)(理想狀態(tài))擴增,數(shù)十個循環(huán)的正常PCR產(chǎn)物去測光密度,可能都會暴表了。 3. 分光光度法又沒法分辨你的產(chǎn)物和其他類型核酸的,所以你的引物在里邊也會正常讀出來的 所以確定有沒有PCR產(chǎn)物只能是電泳或熒光定量的方法來檢驗 祝實驗順利,若有說錯請高手指正哦 |

鐵桿木蟲 (正式寫手)

鐵蟲 (初入文壇)
鐵蟲 (初入文壇)
金蟲 (正式寫手)
琴美喜歡發(fā)呆 不喜歡發(fā)脾氣
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針對你這種情況,我也明白你為什么擴不出來了,PCR是有模板量限制的,這很多人知道但不明白為什么。 舉個例子來說,為什么PCR到40多循環(huán)進入平臺期后就不再有高擴增效率,這并非是酶不強勁,現(xiàn)代重組工業(yè)生產(chǎn)的酶即使是在PCR循環(huán)后期仍舊活力很高。 同樣這也不是組份消耗過多的問題,如果你加入兩倍量dNTP、引物,到40循環(huán)左右仍舊會進入平臺期,擴增效率下降。 問題在哪里,是聚合酶有傾向于結(jié)合完整雙鏈的特點,如果退火條件稍差,模板-引物結(jié)合的趨勢仍會遜于模板模板相結(jié)合,造成其對聚合酶的競爭效應(yīng),所以初始模板過多和循環(huán)一定程度這兩種情況可以說是等同的。 所以,若你擴不出來東西,首先嘗試調(diào)整條件,引物一般只要不是很夸張,一般PCR的應(yīng)用是沒有什么特異特異性的可言的 |

銅蟲 (初入文壇)

銅蟲 (小有名氣)
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