 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (559)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (38)
- >考研 (23)
- >導(dǎo)師招生 (17)
- >休閑灌水 (8)
- >基金申請(qǐng) (5)
- >考博 (5)
- >論文投稿 (4)
- >招聘信息布告欄 (3)
- >碩博家園 (2)
- >化工設(shè)備 (1)
- >外文書(shū)籍求助 (1)
- >文獻(xiàn)求助 (1)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2653 | 回復(fù): 7 | |||
| 本帖產(chǎn)生 1 個(gè) MolEPI ，點(diǎn)擊這里進(jìn)行查看 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿(mǎn)足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話(huà)題的所有回帖 | |||
mjzjily銅蟲(chóng) (初入文壇)
|
[求助]
關(guān)于基因構(gòu)建中開(kāi)放閱讀框架的若干問(wèn)題
|
||
|
Sample Text 我剛接觸分子生物學(xué)不久，現(xiàn)在做基因構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。在閱讀文獻(xiàn)時(shí)，對(duì)開(kāi)放閱讀框架產(chǎn)生了一些疑問(wèn)，請(qǐng)各路高手多多指導(dǎo)了： 1. 我看到一些原核生物基因的ORF，有一部分包含在目的基因的序列中，也有一部分甚至在該基因啟動(dòng)子保守序列的上游。因此，如果要獲得ORF片段的話(huà)，我應(yīng)該如何知道哪些片段序列是ORF？只靠預(yù)測(cè)軟件嗎？ 2. 在原核生物的基因構(gòu)建時(shí)，是不是只要將獲得的目的基因片段連入載體，就可以了？還需要考慮開(kāi)放閱讀框架嗎？若只構(gòu)建目的基因，不考慮ORF，會(huì)不會(huì)影響基因的表達(dá)？ 3. 此外，每個(gè)基因都有一個(gè)ORF嗎？可以不含有ORF？Sample TextSample Text |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專(zhuān)輯推薦
 【分子生物】EPI帖 |
» 猜你喜歡
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：實(shí)驗(yàn)器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：和實(shí)驗(yàn)材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有200人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測(cè)：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測(cè)：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線(xiàn)
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測(cè)重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專(zhuān)業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 一個(gè)關(guān)于水稻基因圖位克隆的問(wèn)題誠(chéng)摯懇求大牛解答
已經(jīng)有35人回復(fù)
- 關(guān)于開(kāi)放閱讀框（ORF）的問(wèn)題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 關(guān)于用農(nóng)桿菌侵染法獲得轉(zhuǎn)基因植物的幾點(diǎn)問(wèn)題
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【求助/交流】關(guān)于開(kāi)放閱讀框（ORF）的一個(gè)問(wèn)題
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助/交流】關(guān)于基因擴(kuò)增的問(wèn)題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】求助：關(guān)于基因敲除后對(duì)下游基因的影響相關(guān)問(wèn)題？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【轉(zhuǎn)帖】我國(guó)成功研究出世界首個(gè)藥用植物基因組框架圖
已經(jīng)有8人回復(fù)
lxj341401
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- MolEPI: 58
- 應(yīng)助: 388 (碩士)
- 貴賓: 0.238
- 金幣: 17138.7
- 紅花: 43
- 帖子: 2251
- 在線(xiàn): 712.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 111074
- 注冊(cè): 2005-11-20
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
4樓2012-04-09 19:20:31
lxj341401
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- MolEPI: 58
- 應(yīng)助: 388 (碩士)
- 貴賓: 0.238
- 金幣: 17138.7
- 紅花: 43
- 帖子: 2251
- 在線(xiàn): 712.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 111074
- 注冊(cè): 2005-11-20
- 專(zhuān)業(yè): 生物化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
西瓜: 金幣+5, MolEPI+1, 專(zhuān)家考核, Good！辛苦~ 2012-04-08 16:56:03
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
西瓜: 金幣+5, MolEPI+1, 專(zhuān)家考核, Good！辛苦~ 2012-04-08 16:56:03
|
ORF（open reading frame，開(kāi)放閱讀框)是DNA上的一段堿基序列，由于擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段堿基序列產(chǎn)生合適大小蛋白才出現(xiàn)的終止密碼子，該段堿基序列編碼一個(gè)蛋白。ORF的識(shí)別是證明一個(gè)新的DNA序列為特定的蛋白質(zhì)編碼基因的部分或全部的先決條件。 1、片段序列是否ORF，自己用眼睛看太辛苦，用軟件預(yù)測(cè)方便快捷，很多生物軟件都能預(yù)測(cè)的，也有在線(xiàn)預(yù)測(cè)工具。 2、在原核生物的基因構(gòu)建時(shí)，要考慮開(kāi)放閱讀框架的，否則影響基因的表達(dá)，出現(xiàn)提前蛋白表達(dá)不準(zhǔn)確或不能表達(dá)的情況。 3、每個(gè)結(jié)構(gòu)基因都有相應(yīng)的每個(gè)基因ORF，編碼RNA的基因一般沒(méi)有ORF。 |
2樓2012-04-08 11:19:05
mjzjily
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 86.6
- 散金: 15
- 帖子: 42
- 在線(xiàn): 32.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1411114
- 注冊(cè): 2011-09-21
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 基因表達(dá)調(diào)控與表觀遺傳學(xué)
  謝謝指導(dǎo)了。還有對(duì)于ORF的長(zhǎng)度，我也有些疑惑。我查了很多有關(guān)原核orf的資料。我的理解是這樣的。您看看是否有錯(cuò)？1.全長(zhǎng)ORF：是指只含有編碼一個(gè)全長(zhǎng)蛋白質(zhì)的序列，也就是指我們平時(shí)從網(wǎng)上查到滴目的基因的序列（從起始密碼到終止密碼）。是這樣嗎？ 2.ORF：網(wǎng)上查到說(shuō)，基因中的ORF包含并位于開(kāi)始編碼與終止編碼之間。那就是說(shuō)，ORF是完全包含在全長(zhǎng)ORF（目的基因序列）中的嗎？還是說(shuō)，ORF中有一部分是目的基因序列，另一部分是目的基因上游的序列，包括啟動(dòng)子，甚至啟動(dòng)子更上游的序列？ 3.基因構(gòu)建時(shí)，要如何考慮ORF的情況，以防止閱讀框架的改變？如果只克隆全長(zhǎng)orf，再連入表達(dá)載體，會(huì)不會(huì)有閱讀框架改變的可能？還是說(shuō)一定要把ORF區(qū)連同目的基因一起構(gòu)建入表達(dá)載體才行？ 謝謝啦~~？ |
3樓2012-04-09 16:50:10
mjzjily
銅蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 86.6
- 散金: 15
- 帖子: 42
- 在線(xiàn): 32.4小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1411114
- 注冊(cè): 2011-09-21
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 基因表達(dá)調(diào)控與表觀遺傳學(xué)
|
以這張圖來(lái)看，TTG是起始密碼子，ORF區(qū)不僅包含了部分基因HDNO的編碼序列，還有部分起始密碼子上游的非編碼序列。所以，我如果要構(gòu)建該基因的表達(dá)載體，1. 是只要直接pcr得到起始密碼子至終止密碼子的目的基因片段，再連入表達(dá)載體？ 2. 還是想要將那些包含啟動(dòng)子在內(nèi)的非編碼區(qū)（起始密碼子之前的序列）和目的基因一起pcr下來(lái)，再連入表達(dá)載體？ 我不知道那種可能會(huì)引起閱讀框架的改變，如果是第二種方法的話(huà)，那如何確定那些非編碼區(qū)是必須的呢？用預(yù)測(cè)ORF的軟件可以嗎？ 謝謝啦~~ 圖例 |
5樓2012-04-09 20:00:31
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑 +4 | 守候夕陽(yáng)CF 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | 小材化本科 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料專(zhuān)業(yè)求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
[教師之家] 焦慮 +8 | 水冰月月野兔 2026-03-13 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 314求調(diào)劑 +8 | 無(wú)懈可擊的巨人 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +10 | 呼呼呼。。。。 2026-03-17 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 冷笙123 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京大學(xué)，080500材料科學(xué)與工程，調(diào)劑 +4 | Jy? 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +3 | Yy7400 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿211 0703方向310分求調(diào)劑 +3 | 努力奮斗112 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | ytter 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 080500，材料學(xué)碩302分求調(diào)劑學(xué)校 +4 | 初識(shí)可樂(lè) 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑一志愿 985 總分 295 +8 | dream…… 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 281求調(diào)劑 +9 | Koxui 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | 一定有學(xué)上- 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +4 | 芬達(dá)46 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 土木第一志愿276求調(diào)劑，科研和技能十分豐富，求新興方向的導(dǎo)師收留 +3 | 土木小天才 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿山大07化學(xué) 332分 四六級(jí)已過(guò) 本科山東雙非 求調(diào)劑！ +3 | 不想理你 2026-03-12 | 3/150 |
|