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mjzjily銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于基因構(gòu)建中開放閱讀框架的若干問題
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Sample Text 我剛接觸分子生物學(xué)不久,現(xiàn)在做基因構(gòu)建的實驗設(shè)計。在閱讀文獻時,對開放閱讀框架產(chǎn)生了一些疑問,請各路高手多多指導(dǎo)了: 1. 我看到一些原核生物基因的ORF,有一部分包含在目的基因的序列中,也有一部分甚至在該基因啟動子保守序列的上游。因此,如果要獲得ORF片段的話,我應(yīng)該如何知道哪些片段序列是ORF?只靠預(yù)測軟件嗎? 2. 在原核生物的基因構(gòu)建時,是不是只要將獲得的目的基因片段連入載體,就可以了?還需要考慮開放閱讀框架嗎?若只構(gòu)建目的基因,不考慮ORF,會不會影響基因的表達? 3. 此外,每個基因都有一個ORF嗎?可以不含有ORF?Sample TextSample Text |
【分子生物】EPI帖 |

銅蟲 (小有名氣)
至尊木蟲 (著名寫手)
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ORF(open reading frame,開放閱讀框)是DNA上的一段堿基序列,由于擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段堿基序列產(chǎn)生合適大小蛋白才出現(xiàn)的終止密碼子,該段堿基序列編碼一個蛋白。ORF的識別是證明一個新的DNA序列為特定的蛋白質(zhì)編碼基因的部分或全部的先決條件。 1、片段序列是否ORF,自己用眼睛看太辛苦,用軟件預(yù)測方便快捷,很多生物軟件都能預(yù)測的,也有在線預(yù)測工具。 2、在原核生物的基因構(gòu)建時,要考慮開放閱讀框架的,否則影響基因的表達,出現(xiàn)提前蛋白表達不準確或不能表達的情況。 3、每個結(jié)構(gòu)基因都有相應(yīng)的每個基因ORF,編碼RNA的基因一般沒有ORF。 |
銅蟲 (初入文壇)
![]() 謝謝指導(dǎo)了。還有對于ORF的長度,我也有些疑惑。我查了很多有關(guān)原核orf的資料。我的理解是這樣的。您看看是否有錯?1.全長ORF:是指只含有編碼一個全長蛋白質(zhì)的序列,也就是指我們平時從網(wǎng)上查到滴目的基因的序列(從起始密碼到終止密碼)。是這樣嗎? 2.ORF:網(wǎng)上查到說,基因中的ORF包含并位于開始編碼與終止編碼之間。那就是說,ORF是完全包含在全長ORF(目的基因序列)中的嗎?還是說,ORF中有一部分是目的基因序列,另一部分是目的基因上游的序列,包括啟動子,甚至啟動子更上游的序列? 3.基因構(gòu)建時,要如何考慮ORF的情況,以防止閱讀框架的改變?如果只克隆全長orf,再連入表達載體,會不會有閱讀框架改變的可能?還是說一定要把ORF區(qū)連同目的基因一起構(gòu)建入表達載體才行? 謝謝啦~~? |

至尊木蟲 (著名寫手)
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