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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » 如何用分子力學方法模擬
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zdz103979358新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何用分子力學方法模擬
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本人初學MS，用分子力學方法研究緩蝕劑分子在金屬表面的自組裝成膜機制。緩蝕劑分子在Fe（001）表面的覆蓋度為0.64n㎡/個，即咪唑啉在Fe（001）表面達到飽和吸附。模擬體系大小為3.24nm×2.24nm×6.03nm，包含16個咪唑啉緩蝕劑分子。 上述該如何構建。本人軟件操作不熟，最好每一步驟寫越詳細越好。萬分感謝。 |
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jiezhou5322
銀蟲 (正式寫手)
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9樓2015-07-17 08:04:24
shengxiang
木蟲 (著名寫手)
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- 專業(yè): 理論和計算化學
2樓2012-04-13 08:02:39
【答案】應助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-04-14 20:50:01
感謝參與，應助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+3, 謝謝~ 2012-04-14 20:50:01
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我也在做這方面的工作，但是沒人指點，一個人根據(jù)文獻，根據(jù)教程在做。很希望懂的人能給出好的建議，雖然樓上說的沒錯，但還是希望樓主多分包容，別人不懂，尤其是沒學過量子化學，計算化學的同學，他們的要求只是想知道軟件的操作，來做個簡單的模擬，二樓沒必要這么鄙視我們這種菜鳥。大家都是從菜鳥過來的。 再回到正題，樓主的問題，可以參考文獻，軟件的操作步驟可以參考教程中有關 內容： 構建結構：使用Build | Crystal 切表面 ： Build | Surface ——>cleave surface 結構優(yōu)化，幾何優(yōu)化，可以用Discover 另外還涉及到建盒子的問題： 用Amorphous Cell 至于怎么操作，看教程吧，涉及到的步驟太多了 |
3樓2012-04-14 12:39:34
sqbin0615
鐵蟲 (小有名氣)
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- 性別: GG
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4樓2012-04-14 14:26:57
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