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淺秋0321新蟲 (初入文壇)
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[求助]
高斯09尋找過渡態(tài),急需幫助,十分感謝
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過渡態(tài)計(jì)算 | 催化與分子模擬 | 量化計(jì)算有意義的討論 |
金蟲 (正式寫手)
| 找過渡態(tài),方法一般用有這么兩種,第一,就是樓主你所用的TS,但是,看了樓主你的說明,建議最好在TS前,使用Redundant Coordinate進(jìn)行冗余坐標(biāo)設(shè)定,將你所要找的相關(guān)過渡態(tài)的關(guān)鍵原子的坐標(biāo)固定住,再Opt,做一次優(yōu)化,再Ts,這樣靠譜點(diǎn),然后別忘了,Ts后,做一個(gè)IRC路徑追蹤,有時(shí)候看虛頻不一定能看出來。第二,用QST2或者QST3,這兩種方法比較偷懶,不過,前提是,你所提供的初始物和產(chǎn)物要進(jìn)行過Opt,如果你用了QST3,還要給一個(gè)你猜測(cè)的構(gòu)型,當(dāng)然,這個(gè)猜測(cè)的不用你來優(yōu)化,個(gè)人淺酌,僅供參考。 |

新蟲 (初入文壇)
新蟲 (初入文壇)
送鮮花一朵 |
十分感謝您!請(qǐng)問“在TS前,使用Redundant Coordinate進(jìn)行冗余坐標(biāo)設(shè)定,將你所要找的相關(guān)過渡態(tài)的關(guān)鍵原子的坐標(biāo)固定住,再Opt”,我將所猜測(cè)的ts初始結(jié)構(gòu)固定了參與過渡態(tài)的原子,也嘗試了下固定參與過渡態(tài)的鍵長(zhǎng),但是不知道是不是我的初始有問題,優(yōu)化了好多步(用Guassview查看是450步),結(jié)構(gòu)已經(jīng)跑掉了,然后是l9999錯(cuò)誤。應(yīng)該怎么辦呢? 用qst3算的時(shí)候,看很多經(jīng)驗(yàn)貼上說需要確定反應(yīng)物和產(chǎn)物一定是在反應(yīng)坐標(biāo)的兩側(cè),這一點(diǎn)讓我有點(diǎn)困惑,不知道對(duì)于我這個(gè)體系,應(yīng)該怎么處理呢? 再次感謝您的幫助哈! |
金蟲 (正式寫手)
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這種情況我也遇見過,原因一般都是固定的原子的鍵長(zhǎng),鍵角的問題,在Gaussian里面,有時(shí)候,可能就是那么一點(diǎn)點(diǎn)差距,得到的結(jié)果就會(huì)有很大的不同,所以,用Redundant Cordinate優(yōu)化找過渡態(tài),是一件很耗費(fèi)腦力和精力的事情,如果實(shí)在是很煩,也可以嘗試scan,不過這個(gè)方法我也只是聽說過,具體的,還是要等高手來解決,建議樓主可以在壇子里搜搜過渡態(tài)的相關(guān)帖子,說不定會(huì)有答案的啦!慢慢來啦!不急的! |

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