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[求助]
關(guān)于密碼子偏好性問題、密碼子優(yōu)化問題~~ 已有1人參與
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原因：本人的核苷酸序列沒有合成的時(shí)候沒有優(yōu)化密碼子，大小是800Kb，開頭已經(jīng)優(yōu)化一部分，中間的主要部分沒有優(yōu)化。 求解答：1.除了重新合成，還有沒有其他的辦法； 2.聽說氨基酸序列只要優(yōu)化前40個(gè)就可以提高一定的表達(dá)量，是否有這么一說，如果不是40個(gè)是多少，大約能夠提高多少表達(dá)量。（希望能有相關(guān)網(wǎng)站和文章）。 3.如果不在優(yōu)化密碼子會有多大的差距性，表達(dá)量會影響多少。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
amisking: 金幣+3, MicEPI+1, 鼓勵發(fā)帖幫助解答問題。 2012-06-19 19:48:26
nongdaylf: 金幣+1, ★★★很有幫助 2012-06-20 10:42:11
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nongdaylf: 金幣+1, ★★★很有幫助 2012-06-20 10:42:11
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1.除了重新合成，還有沒有其他的辦法； 點(diǎn)突變需要優(yōu)化的位點(diǎn) 2.聽說氨基酸序列只要優(yōu)化前40個(gè)就可以提高一定的表達(dá)量，是否有這么一說，如果不是40個(gè)是多少，大約能夠提高多少表達(dá)量。（希望能有相關(guān)網(wǎng)站和文章）。 有這說法，這是經(jīng)驗(yàn)值。如果前幾個(gè)密碼子使用率很低的話會不表達(dá)。 3.如果不在優(yōu)化密碼子會有多大的差距性，表達(dá)量會影響多少。 每段序列不一樣的。 不知道你用什么系統(tǒng)表達(dá)，我們選用了密碼子優(yōu)化的大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)，表達(dá)效果更好。 |
2樓2012-06-19 13:46:25
3樓2012-06-19 14:36:22
4樓2012-06-19 14:36:36
18761615793
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
| 不進(jìn)行密碼子優(yōu)化的話，表達(dá)量會有影響，同時(shí)也要考慮RNA的結(jié)構(gòu)，雖然我不知道怎么優(yōu)化RNA結(jié)構(gòu)的。。。 |
5樓2015-07-15 13:48:47
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6樓2016-03-15 16:41:49
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