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[求助]
關于稀有密碼子的優(yōu)化，請求大家指教
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我的目的基因和載體連接上，是異源表達，怎么都表達不出來，就查看了常見的原因，結(jié)果發(fā)現(xiàn)序列存在很多的稀有密碼子，現(xiàn)在想優(yōu)化后化學合成，我沒有做過這方面的，是不是直接把稀有密碼子換成大腸桿菌偏愛密碼子就可以刻呢？會不會影響表達出來蛋白的構(gòu)象�。恳⒁馐裁茨兀勘磉_菌株是BL21。 希望能給我提點建議 謝謝 我的序列，請大俠幫我看看 atggagagcacaacatcaggattcctaggacccctgctcgtgttacaggcggggtttttcttgttgacaagaatcctcacaataccacagagtctagactcgtggtggacttctctcaattttctagggggagcacccacgtgtcctggccaaaattcgcagtccccaacctccaatcactcaccaacctcttgtcctccaacttgtcctggctatcgctggatgtgtctgcggcgttttatcatattcctcttcatcctgctgctatgcctcatcttcttgttggttcttctggactaccaaggtatgttgcccgtttgtcctctacttccaggaacatcaactaccagcacgggaccatgcagaacctgcacgattcctgctcaaggaacctctatgtttccctcttgttgctgtacaaaaccttcggacggaaactgcacttgtattcccatcccatcatcctgggctttcgcaagattcctatgggagtgggcctcagtccgtttctcctggctcagtttactagtgccatttgttcagtggttcgtagggctttcccccactgtttggctttcagctatatggatgatgtggtattgggggccaagtctgtacaacatcttgagtccctttttacctctattaccaattttcttttgtctttgggtatacatt |
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那是上面還有大腸桿菌不同分型，而不同分型之間也有很大的差異。 不知道應該選擇下面的哪一個？謝謝 -------------------------------------------------------------------------------- Escherichia coli O157:H7 EDL933 [gbbct]: 5347 Escherichia coli O127:H6 [gbbct]: 1 Escherichia coli O111:H- [gbbct]: 7 Escherichia coli O157:H- [gbbct]: 34 Escherichia coli phage EH297 [gbphg]: 2 Escherichia coli CFT073 [gbbct]: 5379 Escherichia coli O157:H45 [gbbct]: 4 Escherichia coli O55:H51 [gbbct]: 1 Escherichia coli O26:H11 [gbbct]: 9 Escherichia coli O63:H6 [gbbct]: 1 Escherichia coli O153:H21 [gbbct]: 2 Escherichia coli EAEC 042 [gbbct]: 4 Escherichia coli W3110 [gbbct]: 4332 Escherichia coli Nissle 1917 [gbbct]: 199 Escherichia coli O63:HNM [gbbct]: 2 Escherichia coli 536 [gbbct]: 4629 Escherichia coli UTI89 [gbbct]: 5211 Escherichia coli O119:UT [gbbct]: 1 Escherichia coli O55:H6 [gbbct]: 1 Escherichia coli OUT:NM [gbbct]: 1 Escherichia coli O15:NM [gbbct]: 1 Escherichia coli O111:NM [gbbct]: 6 Escherichia coli O26:H- [gbbct]: 3 Escherichia coli O103:H2 [gbbct]: 6 plastid Escherichia coli [gbbct]: 3 Escherichia coli [gbbct]: 8087 Escherichia coli O157:H7 str. Sakai [gbbct]: 5442 Escherichia coli O127a:H6 [gbbct]: 2 Escherichia coli O119:H6 [gbbct]: 1 Escherichia coli OUT:H12 [gbbct]: 1 Escherichia coli OUT:H6 [gbbct]: 1 Escherichia coli O86a:H40 [gbbct]: 1 Escherichia coli O86a:H34 [gbbct]: 1 Escherichia coli O111:H2 [gbbct]: 4 Escherichia coli O142:H6 [gbbct]: 1 Escherichia coli O51:H- [gbbct]: 1 Escherichia coli O41:H- [gbbct]: 1 Escherichia coli O154:H9 [gbbct]: 1 Escherichia coli NT:H19 [gbbct]: 3 Escherichia coli NT:H40 [gbbct]: 1 Escherichia coli O13:H11 [gbbct]: 1 Escherichia coli O109:H9 [gbbct]: 1 Escherichia coli O26:NM [gbbct]: 1 Escherichia coli O111:H19 [gbbct]: 1 Escherichia coli O103:K+ [gbbct]: 1 Escherichia coli O115:K+ [gbbct]: 1 Escherichia coli O26:H11:K60 [gbbct]: 1 Escherichia coli O26 [gbbct]: 3 Escherichia coli O104:H12 [gbbct]: 1 Escherichia coli APEC O1 [gbbct]: 4890 Escherichia coli B [gbbct]: 11 Escherichia coli RS218 [gbbct]: 62 Escherichia coli K12 [gbbct]: 14 Escherichia coli O157:H7 [gbbct]: 346 |
7樓2012-08-30 08:56:49
lintaosong
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 7 (幼兒園)
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- 專業(yè): 蛋白質(zhì)組學
【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數(shù) +1
475502411: 金幣+10 2012-08-29 13:17:04
感謝參與，應助指數(shù) +1
475502411: 金幣+10 2012-08-29 13:17:04
| 給你個網(wǎng)站 這里你可以自己按照表達載體進行優(yōu)化http://www.kazusa.or.jp/codon/ |
2樓2012-08-29 11:54:30
3樓2012-08-29 13:16:56
4樓2012-08-29 13:18:49
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