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luke11金蟲 (小有名氣)
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[求助]
嗜熱酶分子模擬對(duì)比
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兩種不同來源的酶熱穩(wěn)定性差異較大。能不能用分子模擬的方法比較其結(jié)構(gòu)？尋找熱穩(wěn)定性的原因。 或是有沒有類似文獻(xiàn)？ |
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luke11
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7樓2012-12-11 17:47:59
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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可以的~ 思路如下： 1.建立兩種酶的三級(jí)結(jié)構(gòu)模型-同源模建 2.進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬-設(shè)置在不同溫度下，比如300K, 400K. 500K,通過軌跡分析了解可能優(yōu)先變性的區(qū)域，比較穩(wěn)定的氫鍵、鹽橋作用等，從而從結(jié)構(gòu)上說明熱穩(wěn)定性差異的原因 |
2樓2012-12-10 20:43:56
luke11
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3樓2012-12-11 10:10:18
4樓2012-12-11 10:55:33
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