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至尊木蟲 (著名寫手)

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[求助] gromacs無法并行安裝出錯(cuò)

系統(tǒng)為RHEL5.1，解壓三個(gè)openmpi-1.6.3，fftw-3.3.3，gromacs-4.5.5
1. openmpi按照./configure->make->make install默認(rèn)安裝
然后在/home/.bashrc中添加export PATH=$PATH:/home/openmpi/bin并source
2. fftw直接安裝雙精度并行版本：./configure --prefix=/home/fftw --enable-mpi --enable-shared->
make-> make install->make distclean
然后在/home/.bashrc中添加 export CPPFLAGS=-I/home/fftw/include
export LDFLAGS=-L/home/fftw/lib并source
3.gromacs直接安裝雙精度并行版本：./configure --prefix=/home/gromacs --enable-mpi --disable-float --program-suffix=_mpid
到這一步出現(xiàn)錯(cuò)誤
checking size of off_t... configure: error: in `/home/gromacs-4.5.5': configure: error: cannot compute sizeof (off_t)
我嘗試將--enable-mpi取消就不會(huì)出錯(cuò)，但也無法進(jìn)行并行安裝了。

請(qǐng)教各位大俠，如何解決此問題？

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1樓 2012-12-28 06:18:04

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