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mahoumeimei金蟲 (小有名氣)
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[求助]
熒光定量PCR-絕對(duì)定量
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最近想通過定量PCR來(lái)分析不同時(shí)期體系中目標(biāo)微生物的含量變化,主要是針對(duì)DNA做絕對(duì)定量。但看了一些資料后,有一點(diǎn)疑問。 做絕對(duì)定量事先不是需要制備質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品來(lái)做標(biāo)準(zhǔn)曲線嗎。資料上是說,通過克隆制備,提取出來(lái)的質(zhì)粒DNA通過分光光度計(jì)測(cè)定濃度,再根據(jù)質(zhì)量信息換算成目標(biāo)基因含量,再稀釋做標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到目標(biāo)基因含量和Ct值的關(guān)系。 可是我不明白,既然通過測(cè)定樣品濃度就可以計(jì)算出目標(biāo)基因的含量,為什么還要多此一舉,做定量PCR呢?或者說,定量PCR的意義不僅僅是這樣,但如果我的目的就是得到目的基因含量的話,其實(shí)是不需要做定量PCR的? 新手學(xué)習(xí)中,希望大家給點(diǎn)建議。非常感謝! |
木蟲 (職業(yè)作家)
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做絕對(duì)定量事先不是需要制備質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品來(lái)做標(biāo)準(zhǔn)曲線嗎。資料上是說,通過克隆制備,提取出來(lái)的質(zhì)粒DNA通過分光光度計(jì)測(cè)定濃度,再根據(jù)質(zhì)量信息換算成目標(biāo)基因含量,再稀釋做標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到目標(biāo)基因含量和Ct值的關(guān)系。 是的,需要做標(biāo)準(zhǔn)曲線。 可是我不明白,既然通過測(cè)定樣品濃度就可以計(jì)算出目標(biāo)基因的含量,為什么還要多此一舉,做定量PCR呢?或者說,定量PCR的意義不僅僅是這樣,但如果我的目的就是得到目的基因含量的話,其實(shí)是不需要做定量PCR的? 你說的方法可以,但是只是在同一時(shí)期時(shí)可以,因?yàn)槟銣y(cè)得總基因組的濃度。 在不同時(shí)期你要考慮時(shí)空表達(dá)問題即不同基因在不同時(shí)期表達(dá)量不一致,即整個(gè)基因組的基因并不都是同一變化規(guī)律及速率,因此,定量PCR可以解決這個(gè)問題。 |
新蟲 (初入文壇)
鐵蟲 (初入文壇)

新蟲 (小有名氣)
| “通過克隆制備,提取出來(lái)的質(zhì)粒DNA通過分光光度計(jì)測(cè)定濃度,再根據(jù)質(zhì)量信息換算成目標(biāo)基因含量,再稀釋做標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到目標(biāo)基因含量和Ct值的關(guān)系!边@里面忽略了一個(gè)問題,就是你的檢測(cè)樣本也要進(jìn)行基因組的提取,然后才能作為模板進(jìn)行pcr定量。此時(shí)出現(xiàn)的一個(gè)問題是,目標(biāo)基因含量和Ct值在一定范圍內(nèi)(即要對(duì)樣本和標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行適當(dāng)?shù)南♂屪鳛槟0澹┎拍芙⒕性關(guān)系,從而確定樣本中目標(biāo)基因含量。另外之所以要進(jìn)行PCR,是因?yàn)樗缺稊?shù)放大了目標(biāo)基因的含量,從而提高了檢測(cè)的靈敏度。 |
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