 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4254 | 回復(fù): 19 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
yida木蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
NPT系綜動(dòng)力學(xué) 已有1人參與
|
|
|
請(qǐng)教下有關(guān)NPT系綜的問(wèn)題，我建的體系是納米金球和多糖的相互作用體系，納米金球在盒子的中心，盒子內(nèi)物質(zhì)均未固定，盒子初始大小（80A,80A,80A），在采用NPT系綜退火后盒子大小變?yōu)椋?7A,77A,77A）,接下來(lái)進(jìn)行了3ns的NPT動(dòng)力學(xué)，壓力1atm，溫度298K，結(jié)果見(jiàn)下圖，盒子變得很小，為（45A,45A,45A）,并且多 糖跑到盒子外邊去了，是模型建的有問(wèn)題嗎？NPT系綜平衡的標(biāo)志是什么��？是不是體系大小不再變化��？盒子為什么會(huì)變小��？ 多糖聚合物分子量很大，像這樣用幾個(gè)重復(fù)單元代替是不是有意義的？ 在動(dòng)力學(xué)的過(guò)程中觀察到金球形狀發(fā)生了變化，是否需要將金球固定？ 根據(jù)水的密度和盒子內(nèi)空余體積計(jì)算應(yīng)加入16968個(gè)水分子，采用sorption加入16968個(gè)水分子后采用Discover進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模擬是否可行？ initial.jpg anneal result.jpg 3ns NPT result.jpg |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿中南化學(xué)337求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有23人回復(fù)
-
265求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
279分求調(diào)劑 一志愿211
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
招收調(diào)劑碩士
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
296求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
招收博士1-2人
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
274求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
290求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- MS程序的forcite模塊中不同約束差別太大是怎么回事？
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 徑向分布函數(shù)的問(wèn)題
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 擴(kuò)散系數(shù)模擬的結(jié)果比資料上的小一個(gè)數(shù)量級(jí)
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 跑動(dòng)力學(xué)密度越跑越大了？？？？？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- MS discover dynanic報(bào)錯(cuò)
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 第一原理動(dòng)力學(xué)的系綜選擇，和各種系綜的輸入文件Example
已經(jīng)有13人回復(fù)
- nvt系綜，系統(tǒng)總能量震蕩厲害
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】VASP做分子動(dòng)力學(xué)模擬NVT系綜下為啥內(nèi)能竟然是升高的？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 動(dòng)力學(xué)跑NPT時(shí)如何得到比體積與時(shí)間的關(guān)系圖？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】EMASS是CPMD最重要的參數(shù)
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 【求助】NPT分子動(dòng)力學(xué)程序
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【討論】系綜問(wèn)題
已經(jīng)有32人回復(fù)
- 【討論】關(guān)于md中系統(tǒng)穩(wěn)定的問(wèn)題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】分子動(dòng)力學(xué)中體系溫度不斷增加?
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助】分子模擬總能量是否一定小于0？
已經(jīng)有13人回復(fù)
yida
木蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1213.9
- 紅花: 1
- 帖子: 243
- 在線: 224.3小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1201744
- 注冊(cè): 2011-02-11
- 專(zhuān)業(yè): 微生物藥物
3樓2013-04-08 22:07:41
stalart
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 284 (大學(xué)生)
- 金幣: 1541.4
- 紅花: 9
- 帖子: 488
- 在線: 129小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1986267
- 注冊(cè): 2012-09-09
- 專(zhuān)業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2013-04-08 20:54:58
stalart
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 284 (大學(xué)生)
- 金幣: 1541.4
- 紅花: 9
- 帖子: 488
- 在線: 129小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1986267
- 注冊(cè): 2012-09-09
- 專(zhuān)業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
4樓2013-04-09 05:19:55
yida
木蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1213.9
- 紅花: 1
- 帖子: 243
- 在線: 224.3小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1201744
- 注冊(cè): 2011-02-11
- 專(zhuān)業(yè): 微生物藥物
6樓2013-04-09 08:47:46
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +4 | ^O^乜 2026-03-19 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +4 | 申子申申 2026-03-19 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 286分人工智能專(zhuān)業(yè)請(qǐng)求調(diào)劑愿意跨考！ +3 | lemonzzn 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 08工學(xué)調(diào)劑 +4 | 用戶573181 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +5 | 曼殊2266 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考博] 東華理工大學(xué)化材專(zhuān)業(yè)26屆碩士博士申請(qǐng) +8 | zlingli 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 18889395102 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿福大288有機(jī)化學(xué)，求調(diào)劑 +3 | 小木蟲(chóng)200408204 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | ydfyh 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +6 | knight344 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 26博士申請(qǐng) +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | p asserby. 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 太想進(jìn)步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 070305求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-14 | 4/200 |
|