 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3067 | 回復(fù): 5 | ||
xyxaiy新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
測序結(jié)果已出，后續(xù)如何分析，以達到菌種鑒定的目的
|
| 測序結(jié)果已出，后續(xù)如何分析，以達到菌種鑒定的目的，要具體的步驟，十分感謝！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿中國海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
294求調(diào)劑材料與化工專碩
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
0856調(diào)劑，是學(xué)校就去
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
梁成偉老師課題組歡迎你的加入
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
復(fù)試調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑 ，六級已過，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
321求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
東華理工大學(xué)化材專業(yè)26屆碩士博士申請
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 不同來源的同種細(xì)菌血緣關(guān)系的鑒定
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 急！PCR產(chǎn)物測序找不到引物
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 微生物生理生化鑒定準(zhǔn)確性
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 質(zhì)粒鑒定是送菌種，還是送已經(jīng)提好了的質(zhì)粒好
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 分離出來的病原菌該如何鑒定到屬?
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 16SDNA-PCR產(chǎn)物測序結(jié)果拿到后該如何處理？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 發(fā)個小文章求畢業(yè)，關(guān)于菌種鑒定的
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 菌種鑒定的問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 菌種鑒定除了做相關(guān)生理生化實驗，有木有簡單點的方法？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 我去做菌種鑒定16S RNA 測出來5條 片段……請問這是怎么回事？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 用PCR擴增后的DNA如何測序？不能直接用PCR就知道是什么菌種之類的吧？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 菌種生理生化特性
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 細(xì)菌鑒定--blast后一定要再到Genbank中檢索才能確定什么菌，得到accession number嗎？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- PCR是陽性但酶切是陰性，怎么回事？
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助/交流】哪里可以做細(xì)菌菌種鑒定？
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助/交流】關(guān)于16srRNA菌種鑒定問題
已經(jīng)有14人回復(fù)
志子
至尊木蟲 (文壇精英)
- MicEPI: 5
- 應(yīng)助: 2847 (講師)
- 貴賓: 0.743
- 金幣: 42456.9
- 散金: 3857
- 紅花: 299
- 帖子: 21362
- 在線: 1136.8小時
- 蟲號: 2471022
- 注冊: 2013-05-19
- 專業(yè): 高分子組裝與超分子結(jié)構(gòu)
2樓2013-05-19 23:56:42
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
對于臨床菌株，美國CLSI組織的文件MM-18A《DNA靶基因序列鑒定細(xì)菌和真菌的解釋標(biāo)準(zhǔn)；批準(zhǔn)指南》詳細(xì)介紹了廣譜基因測序技術(shù)（broad-range gene sequencing）在細(xì)菌與真菌鑒定中的應(yīng)用，其中綜合了細(xì)菌的生化反應(yīng)、rRNA靶基因與其他靶基因序列分析的方法， 表1、16S rRNA基因序列鑒定細(xì)菌的通用解釋標(biāo)準(zhǔn) 相似度 序列的類型 相似度差是否大于0.8% 結(jié)果報告 評述 ≥99.0% 模式菌株 是 屬名和種名 ≥99.0% 模式菌株 否（與他多個種的相似度差小于0.8%） 屬名和多個種名 低鑒定度的鑒定 97.0-98.9% 模式菌株或 有效命名的菌株 能與其他屬區(qū)分 屬 需注明“親緣關(guān)系最近的菌種” 95.0-96.9 模式菌株或 有效命名的菌株 可能的新屬新種，并注明“親緣關(guān)系最近的菌屬” < 95% 模式菌株或 有效命名的菌株 可能的新屬新種 注：分枝桿菌與放線菌除外 |
3樓2013-05-20 01:34:17
20093651
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
- MicEPI: 2
- 應(yīng)助: 212 (大學(xué)生)
- 金幣: 5307.4
- 散金: 3276
- 紅花: 63
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 3731
- 在線: 656.6小時
- 蟲號: 1176129
- 注冊: 2010-12-23
- 專業(yè): 金屬材料表面科學(xué)與工程
4樓2013-05-20 16:13:09
carrieskl
木蟲 (著名寫手)
- MicEPI: 1
- 應(yīng)助: 31 (小學(xué)生)
- 金幣: 3156.3
- 散金: 3
- 紅花: 11
- 帖子: 1037
- 在線: 104.9小時
- 蟲號: 1541324
- 注冊: 2011-12-17
- 性別: MM
- 專業(yè): 非感染性皮膚病
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... EC=MicrobialGenomes 把序列整合好 輸進去 blast一下 |
5樓2013-05-20 17:35:55
Dear97
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 169
- 帖子: 18
- 在線: 10.7小時
- 蟲號: 3491480
- 注冊: 2014-10-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物學(xué)
6樓2015-09-25 14:58:39
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 xyxaiy 的主題更新
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0856調(diào)劑，是學(xué)校就去 +4 | sllhht 2026-03-19 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 梁成偉老師課題組歡迎你的加入 +9 | 一鴨鴨喲 2026-03-14 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 ，六級已過，有科研經(jīng)歷 +11 | 曦熙兮 2026-03-15 | 11/550 |
|
|
[考研] 一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +11 | yangfz 2026-03-17 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑 +7 | 小材化本科 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩調(diào)劑 +5 | 204818@lcx 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料專業(yè)求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料/英一數(shù)二/總分289/已過A區(qū)線 +7 | 步川酷紫123 2026-03-13 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +3 | 一志愿京區(qū)211 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 280求調(diào)劑 +6 | 咕嚕曉曉 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +6 | Zz版 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 太想進步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +6 | 拾光任染 2026-03-15 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | ?醬給調(diào)劑跪了 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +4 | 學(xué)員97LZgn 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機器學(xué)習(xí) 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 冬十三 2026-03-13 | 3/150 |
|