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菜鳥(niǎo)求助:PCR擴(kuò)增和擴(kuò)增產(chǎn)物的克隆??
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書(shū)上如是說(shuō):在許多研究中,需要將PCR產(chǎn)物克隆,以獲得目的DNA片段。 我不明白的地方是,要獲得目的DNA片段就是通過(guò)PCR。PCR的產(chǎn)物就是DNA片段,要將產(chǎn)物克隆就是要獲得更多的片段,繼續(xù)PCR不就行了么?? 我理解的是PCR的產(chǎn)物中只有兩條模板鏈?zhǔn)情L(zhǎng)的,其他的都是短的對(duì)嗎?可以P出與模板鏈一樣長(zhǎng)的鏈嗎?? 菜鳥(niǎo)問(wèn)題,大蝦見(jiàn)笑 |
鐵桿木蟲(chóng) (職業(yè)作家)

新蟲(chóng) (初入文壇)
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關(guān)于你的這段話(huà)的2個(gè)問(wèn)題: 1 PCR就是對(duì)目的DNA的富集過(guò)程。如果只想做多態(tài)性研究就不必做克隆,但以下情況需要你做克隆:a:要測(cè)序的目的片段較短,需要連到載體克隆后測(cè)序;b:認(rèn)為目的基因內(nèi)存在雜合位點(diǎn),堿基的缺失和突變等情況;c:下一步試驗(yàn)的需要,比如需要對(duì)目的基因進(jìn)行功能研究 ; 2 既然PCR是目的DNA富集的過(guò)程,經(jīng)過(guò)30輪左右的指數(shù)定增過(guò)程,最終PCR產(chǎn)物中都是您的目的DNA大小的DNA片段。 |
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"我理解的是PCR的產(chǎn)物中只有兩條模板鏈?zhǔn)情L(zhǎng)的,其他的都是短的對(duì)嗎?可以P出與模板鏈一樣長(zhǎng)的鏈嗎??" 除了模板還是原來(lái)那么長(zhǎng)(排除在反應(yīng)中被降解的理想情況下),還會(huì)以線(xiàn)性增長(zhǎng)擴(kuò)增一頭是引物,一頭是一直延伸超過(guò)目的片段長(zhǎng)度的,如果延伸溫度足夠長(zhǎng),會(huì)一直延伸到比較復(fù)雜的結(jié)構(gòu)為止,然后是以指數(shù)增長(zhǎng)擴(kuò)增的兩頭是引物的目的產(chǎn)物,估計(jì)就是你說(shuō)的短的產(chǎn)物。 一般的PCR用聚合酶不能進(jìn)行超長(zhǎng)片段擴(kuò)增,不過(guò),如果模板本身是PCR產(chǎn)物,再次PCR是有可能擴(kuò)增到模板那么長(zhǎng)的,按理論說(shuō)是完全有可能,但實(shí)際試驗(yàn)操作時(shí),還是要進(jìn)行摸索,主要是PCR產(chǎn)物非特異性擴(kuò)增的條帶以及其他原因抑制擴(kuò)增,通常需要做不同稀釋倍數(shù)的摸索。 |

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影響PCR的因素很多,而且擴(kuò)增的過(guò)程有可能會(huì)發(fā)生突變,而克隆得到的質(zhì)粒,在大腸桿菌內(nèi)擴(kuò)增保真率比PCR更高,質(zhì)粒復(fù)制再提取質(zhì)粒獲得完全相同的片段要比直接PCR來(lái)得容易也更有保證。而且PCR會(huì)有一定的非特異帶非目的帶擴(kuò)增出來(lái),如果得到的片段需要進(jìn)行克隆進(jìn)行表達(dá)或其他功能研究,就需要在克隆后鑒定是否目的帶。 如果只是檢測(cè)是否有預(yù)期的片段,直接PCR就可以了,更常見(jiàn)的是實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè),不用再進(jìn)行克隆也能達(dá)到某些目的,比如mRNA的轉(zhuǎn)錄水平等。 |

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