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[求助]
菜鳥求助:PCR擴(kuò)增和擴(kuò)增產(chǎn)物的克。?
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書上如是說:在許多研究中,需要將PCR產(chǎn)物克隆,以獲得目的DNA片段。 我不明白的地方是,要獲得目的DNA片段就是通過PCR。PCR的產(chǎn)物就是DNA片段,要將產(chǎn)物克隆就是要獲得更多的片段,繼續(xù)PCR不就行了么?? 我理解的是PCR的產(chǎn)物中只有兩條模板鏈?zhǔn)情L的,其他的都是短的對嗎?可以P出與模板鏈一樣長的鏈嗎?? 菜鳥問題,大蝦見笑 |
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)

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關(guān)于你的這段話的2個問題: 1 PCR就是對目的DNA的富集過程。如果只想做多態(tài)性研究就不必做克隆,但以下情況需要你做克隆:a:要測序的目的片段較短,需要連到載體克隆后測序;b:認(rèn)為目的基因內(nèi)存在雜合位點(diǎn),堿基的缺失和突變等情況;c:下一步試驗(yàn)的需要,比如需要對目的基因進(jìn)行功能研究 ; 2 既然PCR是目的DNA富集的過程,經(jīng)過30輪左右的指數(shù)定增過程,最終PCR產(chǎn)物中都是您的目的DNA大小的DNA片段。 |
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"我理解的是PCR的產(chǎn)物中只有兩條模板鏈?zhǔn)情L的,其他的都是短的對嗎?可以P出與模板鏈一樣長的鏈嗎??" 除了模板還是原來那么長(排除在反應(yīng)中被降解的理想情況下),還會以線性增長擴(kuò)增一頭是引物,一頭是一直延伸超過目的片段長度的,如果延伸溫度足夠長,會一直延伸到比較復(fù)雜的結(jié)構(gòu)為止,然后是以指數(shù)增長擴(kuò)增的兩頭是引物的目的產(chǎn)物,估計(jì)就是你說的短的產(chǎn)物。 一般的PCR用聚合酶不能進(jìn)行超長片段擴(kuò)增,不過,如果模板本身是PCR產(chǎn)物,再次PCR是有可能擴(kuò)增到模板那么長的,按理論說是完全有可能,但實(shí)際試驗(yàn)操作時,還是要進(jìn)行摸索,主要是PCR產(chǎn)物非特異性擴(kuò)增的條帶以及其他原因抑制擴(kuò)增,通常需要做不同稀釋倍數(shù)的摸索。 |

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影響PCR的因素很多,而且擴(kuò)增的過程有可能會發(fā)生突變,而克隆得到的質(zhì)粒,在大腸桿菌內(nèi)擴(kuò)增保真率比PCR更高,質(zhì)粒復(fù)制再提取質(zhì)粒獲得完全相同的片段要比直接PCR來得容易也更有保證。而且PCR會有一定的非特異帶非目的帶擴(kuò)增出來,如果得到的片段需要進(jìn)行克隆進(jìn)行表達(dá)或其他功能研究,就需要在克隆后鑒定是否目的帶。 如果只是檢測是否有預(yù)期的片段,直接PCR就可以了,更常見的是實(shí)時定量PCR檢測,不用再進(jìn)行克隆也能達(dá)到某些目的,比如mRNA的轉(zhuǎn)錄水平等。 |

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