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marineman至尊木蟲 (知名作家)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組分析顯著基因只有5個(gè)，原因何在？
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分析衣藻油脂代謝，油脂含量和生物量差別都很大，為啥轉(zhuǎn)錄組分析顯著記憶只有五個(gè)？ 這個(gè)太離譜了。 轉(zhuǎn)錄組分析需要注意什么？ 只有建設(shè)性意見會(huì)給金幣，灌水的抱歉。 |
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marineman
至尊木蟲 (知名作家)
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3樓2013-07-18 07:02:01
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你用的對照組可能不是很恰當(dāng)，多數(shù)的tools 尋找差異基因基于不同對照整體轉(zhuǎn)錄的背景被視為是相同的，通過擬合不同曲線來判斷置信區(qū)間，如果你兩個(gè)sample 本身差異非常大的話，任何工具處理的時(shí)候方差太大，可信差異基因就會(huì)非常非常的少， 你可以先畫個(gè)表達(dá)背景的density distribution先看看，另外在call DEG時(shí)候，是否有replication， 用的工具什么的都有很大的差別 |
2樓2013-07-17 18:46:00
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