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[求助]
急！急！急！對轉錄組測序結果進行驗證，如何選定基因
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急！急！急！轉錄組測序后，得到大量差異表達的基因，現(xiàn)在要對差異表達的基因做實時定量PCR驗證，有點迷茫了，那么多差異表達的基因應該怎么選呢？ 可以按以下原則選嗎？ 1 差異表達的倍數，倍數越高越好 2 p值和FDR值越小越好，有很多是0的，那是不是選2者值均為0的呢 3 選擇的基因是否要在兩個樣本中都表達呢？有的差異倍數很高，但是只在一個樣本中表達，在另一個中表達量為0，這樣的可以選擇做驗證嗎？ 有沒有哪位大俠做過此類實驗，請不吝賜教！ |
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2樓2013-04-10 21:46:50
foreverlukel
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【答案】應助回帖
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你是我的幸福(myprayer代發(fā)): 金幣+1, 贈人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊�？鞓访恳惶� 2013-04-25 16:56:19
你是我的幸福: 金幣+5, ★有幫助 2013-04-25 21:40:02
kx444555: 金幣+3, 鼓勵交流 2013-06-04 12:37:59
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kx444555: 金幣+3, 鼓勵交流 2013-06-04 12:37:59
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首先希望你不只是為了驗證而驗證，最好還有其他意義，這樣就要看你選什么樣的基因了。 其次你說的那些條件都算在挑選基因的原則，但只是最開始篩選基因的原則，等把基因找到了之后，也許這個基因都設計不出來合適的引物，所以可以找到基因后看看能不能按照實時定量引物設計原則設計出好的引物。 最后你說的在一個樣本中表達，在另一個樣本中表達，這不正是你想要的差異么，實時定量就是為了看他表達的動態(tài)過程。轉錄組測序得到的基因表達量只能作為參考，不能下定論，所以剛才你說的在另一個樣本中不表達也是不一定的事，都要經過驗證的。 祝樓主成功發(fā)表好文章！  |
3樓2013-04-25 15:25:58
4樓2013-05-13 20:28:39
5樓2013-06-04 10:49:06
6樓2013-06-27 17:22:23
shucanwei
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7樓2013-06-30 08:51:22
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8樓2013-07-03 16:47:25
9樓2014-07-24 15:41:23
10樓2015-12-21 23:19:50
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