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急！急！急！對轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進行驗證，如何選定基因
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急！急！急！轉(zhuǎn)錄組測序后，得到大量差異表達的基因，現(xiàn)在要對差異表達的基因做實時定量PCR驗證，有點迷茫了，那么多差異表達的基因應(yīng)該怎么選呢？ 可以按以下原則選嗎？ 1 差異表達的倍數(shù)，倍數(shù)越高越好 2 p值和FDR值越小越好，有很多是0的，那是不是選2者值均為0的呢 3 選擇的基因是否要在兩個樣本中都表達呢？有的差異倍數(shù)很高，但是只在一個樣本中表達，在另一個中表達量為0，這樣的可以選擇做驗證嗎？ 有沒有哪位大俠做過此類實驗，請不吝賜教！ |
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sdynyam
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foreverlukel
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你是我的幸福(myprayer代發(fā)): 金幣+1, 贈人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊�？鞓访恳惶� 2013-04-25 16:56:19
你是我的幸福: 金幣+5, ★有幫助 2013-04-25 21:40:02
kx444555: 金幣+3, 鼓勵交流 2013-06-04 12:37:59
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kx444555: 金幣+3, 鼓勵交流 2013-06-04 12:37:59
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首先希望你不只是為了驗證而驗證，最好還有其他意義，這樣就要看你選什么樣的基因了。 其次你說的那些條件都算在挑選基因的原則，但只是最開始篩選基因的原則，等把基因找到了之后，也許這個基因都設(shè)計不出來合適的引物，所以可以找到基因后看看能不能按照實時定量引物設(shè)計原則設(shè)計出好的引物。 最后你說的在一個樣本中表達，在另一個樣本中表達，這不正是你想要的差異么，實時定量就是為了看他表達的動態(tài)過程。轉(zhuǎn)錄組測序得到的基因表達量只能作為參考，不能下定論，所以剛才你說的在另一個樣本中不表達也是不一定的事，都要經(jīng)過驗證的。 祝樓主成功發(fā)表好文章！  |
3樓2013-04-25 15:25:58
大兔子1113
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5樓2013-06-04 10:49:06
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