 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 10952 | 回復(fù): 9 | |||
[求助]
急！急！急！對(duì)轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證，如何選定基因
|
|
急！急！急！轉(zhuǎn)錄組測序后，得到大量差異表達(dá)的基因，現(xiàn)在要對(duì)差異表達(dá)的基因做實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證，有點(diǎn)迷茫了，那么多差異表達(dá)的基因應(yīng)該怎么選呢？ 可以按以下原則選嗎？ 1 差異表達(dá)的倍數(shù)，倍數(shù)越高越好 2 p值和FDR值越小越好，有很多是0的，那是不是選2者值均為0的呢 3 選擇的基因是否要在兩個(gè)樣本中都表達(dá)呢？有的差異倍數(shù)很高，但是只在一個(gè)樣本中表達(dá)，在另一個(gè)中表達(dá)量為0，這樣的可以選擇做驗(yàn)證嗎？ 有沒有哪位大俠做過此類實(shí)驗(yàn)，請(qǐng)不吝賜教！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
蛋白質(zhì)檢測：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有164人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
留學(xué)--博士招生
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
化學(xué)工程，本211，求調(diào)劑，ab區(qū)不限
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 轉(zhuǎn)錄組測序還是基因組測序？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 轉(zhuǎn)錄組測序所需RNA提取
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 《求助》 轉(zhuǎn)錄組樣品，混合與分開測序的區(qū)別？�。�！
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組測序分析接種后感病和抗病植物能分析到什么水平
已經(jīng)有5人回復(fù)
- Illumina solexa轉(zhuǎn)錄組測序
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 植物轉(zhuǎn)錄組測序
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 2011NSFC申請(qǐng)時(shí)寫的用基因芯片，現(xiàn)在準(zhǔn)備改成轉(zhuǎn)錄組測序，不知這樣調(diào)整行不行？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 轉(zhuǎn)錄組測序 可行性
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 求高人幫忙解讀一下關(guān)于水稻轉(zhuǎn)錄組測序的文獻(xiàn)
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 求高人翻譯關(guān)于水稻轉(zhuǎn)錄組測序的一段摘要
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【資料】番茄基因組完成測序（附Nature全文）
已經(jīng)有73人回復(fù)
- 抗寒脅迫下，做轉(zhuǎn)錄組測序的取樣部位問題。
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 已取得基因反向測序結(jié)果，要先如何處理再上blast比對(duì)？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 一個(gè)關(guān)于全基因組測序的問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 怎么進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析免費(fèi)軟件
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 轉(zhuǎn)錄組研究前沿
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 請(qǐng)問高通量測序中深度和覆蓋度是什么意思？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 上海晶能轉(zhuǎn)錄組測序可靠嗎？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】請(qǐng)教達(dá)人：轉(zhuǎn)錄組測序北京哪個(gè)公司做得出色、可靠一些？
已經(jīng)有9人回復(fù)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
你是我的幸福(myprayer代發(fā)): 金幣+1, 贈(zèng)人玫瑰手有余香，鼓勵(lì)應(yīng)助，分子生物版塊期待你的更多精彩。 2013-04-11 08:20:58
你是我的幸福: 金幣+3, ★有幫助 2013-04-25 21:40:18
kx444555: 金幣+1, 鼓勵(lì)交流 2013-06-04 12:37:43
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
你是我的幸福(myprayer代發(fā)): 金幣+1, 贈(zèng)人玫瑰手有余香，鼓勵(lì)應(yīng)助，分子生物版塊期待你的更多精彩。 2013-04-11 08:20:58
你是我的幸福: 金幣+3, ★有幫助 2013-04-25 21:40:18
kx444555: 金幣+1, 鼓勵(lì)交流 2013-06-04 12:37:43
| 一般是采用以上標(biāo)準(zhǔn)，另外可以結(jié)合信號(hào)通路和基因功能。但是有時(shí)候不是差異倍數(shù)越高的越好。祝你好運(yùn)啊 |
2樓2013-04-10 21:46:50
foreverlukel
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 65.5
- 紅花: 2
- 帖子: 30
- 在線: 9.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 2403299
- 注冊(cè): 2013-04-06
- 專業(yè): 免疫生物學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
你是我的幸福(myprayer代發(fā)): 金幣+1, 贈(zèng)人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊�？鞓访恳惶� 2013-04-25 16:56:19
你是我的幸福: 金幣+5, ★有幫助 2013-04-25 21:40:02
kx444555: 金幣+3, 鼓勵(lì)交流 2013-06-04 12:37:59
你是我的幸福(myprayer代發(fā)): 金幣+1, 贈(zèng)人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊�？鞓访恳惶� 2013-04-25 16:56:19
你是我的幸福: 金幣+5, ★有幫助 2013-04-25 21:40:02
kx444555: 金幣+3, 鼓勵(lì)交流 2013-06-04 12:37:59
|
首先希望你不只是為了驗(yàn)證而驗(yàn)證，最好還有其他意義，這樣就要看你選什么樣的基因了。 其次你說的那些條件都算在挑選基因的原則，但只是最開始篩選基因的原則，等把基因找到了之后，也許這個(gè)基因都設(shè)計(jì)不出來合適的引物，所以可以找到基因后看看能不能按照實(shí)時(shí)定量引物設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)出好的引物。 最后你說的在一個(gè)樣本中表達(dá)，在另一個(gè)樣本中表達(dá)，這不正是你想要的差異么，實(shí)時(shí)定量就是為了看他表達(dá)的動(dòng)態(tài)過程。轉(zhuǎn)錄組測序得到的基因表達(dá)量只能作為參考，不能下定論，所以剛才你說的在另一個(gè)樣本中不表達(dá)也是不一定的事，都要經(jīng)過驗(yàn)證的。 祝樓主成功發(fā)表好文章！  |
3樓2013-04-25 15:25:58
sdynyam
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 3.1
- 帖子: 28
- 在線: 11.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 899419
- 注冊(cè): 2009-11-10
- 專業(yè): 植物遺傳學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★
kx444555: 金幣+1, 鼓勵(lì)交流 2013-06-04 12:38:16
kx444555: 金幣+1, 鼓勵(lì)交流 2013-06-04 12:38:16
| 你不可能把所有差異基因都驗(yàn)證的，只需要驗(yàn)證幾條基因，把你從這些基因差異中得到的結(jié)論說清楚，你就已經(jīng)是大師了。建議你先把GO和KEGG的聚類分析好好研究一下，看看里面跟你感興趣的研究方向有關(guān)的基因是不是有差異，特別是KEGG，是個(gè)強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫，從它的圖上能得到很多信息。這個(gè)轉(zhuǎn)錄組的研究必須結(jié)合自己的研究方向，不可能全部的信息的都用上的，要能找到一個(gè)深入的研究。 |
4樓2013-05-13 20:28:39
大兔子1113
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 7.5
- 帖子: 2
- 在線: 2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2319449
- 注冊(cè): 2013-03-05
- 專業(yè): 植物遺傳學(xué)
5樓2013-06-04 10:49:06
decry
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 31.5
- 帖子: 6
- 在線: 10小時(shí)
- 蟲號(hào): 2464099
- 注冊(cè): 2013-05-14
- 專業(yè): 植物病理學(xué)
6樓2013-06-27 17:22:23
shucanwei
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 13 (小學(xué)生)
- 金幣: 4809.2
- 散金: 70
- 紅花: 3
- 帖子: 464
- 在線: 72.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 994653
- 注冊(cè): 2010-04-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 天體力學(xué)和人造衛(wèi)星動(dòng)力學(xué)
7樓2013-06-30 08:51:22
grape_vine
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 52 (初中生)
- 金幣: 1139
- 紅花: 6
- 帖子: 259
- 在線: 95.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2444701
- 注冊(cè): 2013-05-02
- 專業(yè): 果樹學(xué)
8樓2013-07-03 16:47:25
9樓2014-07-24 15:41:23
10樓2015-12-21 23:19:50
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 你是我的幸福 的主題更新
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 希望上岸阿小楊 2026-03-23 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料求調(diào)劑 一志愿哈工大總分298分，前三科223分 +5 | dongfang59 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +10 | Micky11223 2026-03-25 | 13/650 |
|
|
|
[有機(jī)交流]
高溫高壓反應(yīng)求助
 10+4
|
chibby 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 學(xué)碩274求調(diào)劑 +5 | Li李魚 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿上海理工能源動(dòng)力（085800）310分求調(diào)劑 +3 | zhangmingc 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +17 | 顧九笙要謙虛 2026-03-24 | 23/1150 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +9 | 上岸吧ZJY 2026-03-22 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +7 | 鈕恩雪 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿211 初試270分 求調(diào)劑 +6 | 谷雨上岸 2026-03-23 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 309求調(diào)劑 +4 | gajsj 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑310 +3 | 溫柔的晚安 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 290分調(diào)劑求助 +3 | 吉祥止止陳 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 食品專碩 一志愿雙一流 328 +3 | xiaom99 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +3 | desto 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 26申博自薦 +3 | whh869393 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 384求調(diào)劑 +3 | 子系博 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +4 | LHHL66 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿070300浙大化學(xué)358分，求調(diào)劑！
+4
|
酥酥魚.. 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求 B區(qū) 調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-21 | 3/150 |
|