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綠藻植物基因組DNA提取
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| 最近準(zhǔn)備提某種藻類植物的基因組DNA,新手上路,請大家推薦下手提用哪些方法好用點? 還有一個問題,就是如何能夠去除色素? |

銀蟲 (初入文壇)

木蟲 (正式寫手)
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1 取鹽藻20 ml,4 000 rps離心3 min,用槍移上清,最后留約1 ml,吹勻后移到1.5 mlEP管內(nèi),4 000 rps離心5 min。 2 向沉淀中加入567 μL的TE緩沖掖,用槍吹打使其充分懸浮,加3 μL的蛋白酶K(20mg/ml,該酶在95℃,10 min才失活),30 μL 10%的SDS,37 ℃溫育1 h(每15 min混勻一次) 3 加100 μL的5 M的NaCl,用槍混勻,再加80 μL CTAB/NaCl(該試劑在使用前65℃溫育使融化,再在室溫冷卻到30℃使用),混勻,65℃溫育10 min。 4 加等體積(約750μL)氯仿/異戊純(24/1),混勻(輕搖約5 min),12 000rps離心7 min,轉(zhuǎn)上清到新管中。 5 加等體積的酚/氯仿/異戊醇(25/24/1),12 000 rpm離心7 min,轉(zhuǎn)上清到新管中。 6 加入0.6體積的異丙醇,輕輕混合直到DNA沉淀下來,靜置5 min,12 000 rpm離心5 min,棄上清,用70%乙醇洗滌沉淀兩次(12 000 rpm離心1 min)。 7棄上清,放置使乙醇干燥。重溶于30~50μL TE(加RNA酶)中,65℃溫育15 min,然后放置-20℃冰箱保存。 注: 1 一般基因組DNA能比質(zhì)粒放得更久,且-20℃易降解而-80℃不易降解 2 步驟2中細胞懸浮后加入SDS和PK后可以直接顛倒EP管以混勻 3 步驟2后各步驟需要溫和操作,防止基因組斷裂。 4 CTAB提取液: NaCl 1.4MCTAB(w/v) 2%Tris•Cl 100mMEDTA 20mM巰基乙醇 0.2% |


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