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huangshuang1木蟲 (著名寫手)
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[求助]
時(shí)間步長(zhǎng)1fs
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審稿人意見： 不能武斷地說模擬時(shí)間步長(zhǎng)1.0 fs。在分子動(dòng)力學(xué)模擬中，時(shí)間尺度是根據(jù)描述van der Waals相互作用的Lennard-Jones勢(shì)中的參數(shù)來決定的，在模擬中, 選其中一個(gè)原子的質(zhì)量m和直徑分\sigma別作為質(zhì)量尺度和長(zhǎng)度的尺度，取某一對(duì)原子的相互作用\epsilon為能量尺度，這樣就確定了在模擬中的時(shí)間尺度為t=(m\sigma^2/\epsilon)^(1/2),根據(jù)這些具體的參數(shù)值來計(jì)算時(shí)間尺度。參見書41頁(yè): Daan Frenkel & Berend Smit, Understanding Molecular Simulation : From Algorithms to Applications, 第二版。 請(qǐng)問，這怎么計(jì)算出準(zhǔn)確的時(shí)間步長(zhǎng)？？有誰有具體的計(jì)算過程嗎？ |
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2樓2013-08-05 15:11:55
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huangshuang1: 金幣+40, ★★★★★最佳答案, 謝謝你拉，很有幫助 2013-08-08 08:19:12
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huangshuang1: 金幣+40, ★★★★★最佳答案, 謝謝你拉，很有幫助 2013-08-08 08:19:12
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審稿人說的那本書在這里下載 http://ishare.iask.sina.com.cn/f/16968127.html 這本書41頁(yè)講的是簡(jiǎn)化單位的問題，完全不是什么時(shí)間尺度 而且積分步長(zhǎng)本來就是人為指定的，一般在溶液中視情況定位2fs或1fs，在真空中定為0.5fs，當(dāng)然具體的原因可以看陳正隆的那本書，不過沒有哪篇論文會(huì)去講積分步長(zhǎng)是怎么選擇的。。。 懷疑審稿人不是專業(yè)做分子模擬的，隨便提了個(gè)問題敷衍了事，你可以和你導(dǎo)師商量下怎么弄 |
3樓2013-08-07 23:27:14
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