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lunalovehj木蟲 (小有名氣)
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用16s rDNA與16s rRNA的測(cè)序做土壤微生物多樣性有什么區(qū)別？
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最近讀了好多關(guān)于土壤微生物多樣性研究的文章，大多都是要用16s rRNA測(cè)序來做的，大多都是譜了一張以“門”為分類階元的圖，表示微生物的組成。 但是有個(gè)測(cè)序公司的人想跟我們簽訂16s rDNA測(cè)序的合同，宣傳說也可以研究土壤群落結(jié)構(gòu)多樣性，那么這兩者測(cè)出來有什么差別呢？ 我們實(shí)驗(yàn)室才開始接觸分子試驗(yàn)，所以有好多理論都不懂，請(qǐng)各位不吝賜教呀~~ |
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16S rDNA測(cè)的是所有細(xì)菌的（包括活菌和死菌）；16S rRNA測(cè)的是現(xiàn)存的活的細(xì)菌。 解釋：DNA是比較穩(wěn)定的，有些細(xì)菌死亡后，DNA仍存在于土壤之中。而RNA不穩(wěn)定，很容易被分解，你提到的RNA就說明是現(xiàn)存的活菌的，因此RNA更能說明土壤微生物的多樣性。不過，貌似從土壤中去提RNA真的不太好提。。 |
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lunalovehj2樓2013-09-18 13:17:24
lunalovehj
木蟲 (小有名氣)
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3樓2013-09-18 16:57:20
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