| 查看: 4248 | 回復(fù): 49 | |||
山水88木蟲 (正式寫手)
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[求助]
Red重組老是不成功,求救
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| 用Red重組敲除基因,做了一個多月了,還是沒有成功,前期是抗性基因片段PCR量低,后來換了酶解決了,轉(zhuǎn)了pKD46之后的菌株誘導(dǎo)表達(dá)到OD0.6制備感受態(tài)轉(zhuǎn)化PCR片段,過程應(yīng)該都是比較常規(guī)的了,可是這么久就是不成功,請問有做過的指點(diǎn)一下,謝謝了,浪費(fèi)不起時間了 |
生物科學(xué) |
銅蟲 (小有名氣)
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反正我最開始用tet做過 后來覺得問題太多(你假的菌落是不是比正常的? BW25113長的很快的,菌落比dh5alpha也大很多) 直接換其他抗性了,Kan clora spec都不會長假的,就是clora可能選擇壓力略大,不過長出來的都是一定有抗性的,另外重組質(zhì)粒用psim19效率比pkd46高差不多一個數(shù)量級(pBad其實(shí)是個比較爛的誘導(dǎo)promoter)。 Ara0.2%差不多是10mM還多了,06年有文章說這個略微有點(diǎn)高(其實(shí)高濃度的Ara對E coli有點(diǎn)毒性),不過這個和誘導(dǎo)時間有關(guān),我是OD=0.1誘導(dǎo)后1hr的。 |
金蟲 (初入文壇)
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以前我們做這個轉(zhuǎn)化效率不高,就是增加感受態(tài)和PCR片段的量,50ml菌體做一管感受態(tài),PCR產(chǎn)物50或100ul沉淀到5ul直接全部轉(zhuǎn)掉 假陽性多可能是你PCR的模板沒弄好,一定不能有質(zhì);煸诶锩。我們用的是pIJ773,一定要確保完全酶切,片段電泳后膠回收,處理成線性片段再去做模板 |
銅蟲 (小有名氣)
木蟲 (著名寫手)
博士,副教授
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這是我能想到的解決辦法:我看你做的實(shí)驗(yàn),不應(yīng)該是抗生素失效的問題,不過四環(huán)素抗性確實(shí)不好用,你可以給朱老師索要其他抗性質(zhì)粒做個對照試試,也許就做出來了。同時我建議你檢查所用的所有的實(shí)驗(yàn)材料,重組質(zhì)粒,包括菌株是否正確,我做重組時,都是一個一個材料核實(shí),確保重組系統(tǒng)沒有問題,有些問題是當(dāng)時我自己都沒有料想到的,覺得不應(yīng)該出現(xiàn)的問題,但是就是出錯了,(比如曾經(jīng)碰到重組質(zhì)粒出錯,抗生素失效,而這些都是問題的關(guān)鍵)?傊,重組碰到的問題太多,細(xì)心才能解決所有的問題。 |

銅蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)
木蟲 (著名寫手)
博士,副教授
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http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582 我做過Red重組敲除大腸桿菌基因,上面是我發(fā)的帖子,混總了一下相關(guān)問題,你可以參考一下,如果有問題,歡迎交流。 |

木蟲 (正式寫手)
木蟲 (正式寫手)
銅蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)
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1、將PKD46化轉(zhuǎn)到大腸桿菌中,挑取單克隆,提取質(zhì)粒,初步驗(yàn)證后,接種至AMP培養(yǎng)基中30度過夜培養(yǎng),次日1:50轉(zhuǎn)接至新鮮培養(yǎng)基,培養(yǎng)至OD600=0.2時加入阿拉伯糖至終濃度0.2%,繼續(xù)培養(yǎng)到OD0.6時,制備電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞,10%甘油洗滌。 2、將打靶分子(Tet抗性)>100ng左右(同源臂50bp),2500V電轉(zhuǎn)至感受態(tài)中,30度培養(yǎng)2h后,涂布于Tet抗性的LB平板,37度過夜培養(yǎng)。 你說的Tet避光才開始我不知道,但是同時做了DH5a的對照沒有長出菌落,因此抗性是存在的或者說操作對其影響不是很大。然后PCR完后沒有經(jīng)過DpnI處理而是跑膠回收的,在長出的菌落里提質(zhì)粒沒有發(fā)現(xiàn)模板質(zhì)粒的存在,因此這步也應(yīng)該不是問題吧。導(dǎo)入的抗性基因片段之前是PCR量太少,后面換了酶回收以后取0.5ul就能夠達(dá)到和Marker差不多的量度了,而且這樣我還是大量回收然后共沉之后電轉(zhuǎn)的。我能想到的就是這些了,謝謝! |
銅蟲 (小有名氣)
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