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gromacs pull的問題!10金幣 已有1人參與
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設定了一個離子通道蛋白A,和一個離子B,想讓B 通過pull的umbrella模式通過通道A 我的辦法1,設定蛋白A是參考組,pull B,但是離子B停留在蛋白A中心不再向下穿透。 辦法2,在通道A另一端設置一個參考離子C,把B向離子C 拉動,但是離子沒有向蛋白方向運動而是從另一側反向接近C。 請問怎么回事,我mdp設置砍了好幾遍也看不出解決問題的方法 有沒有人知道? |
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