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ptccc銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
PET-32A重組質(zhì)粒構(gòu)建 已有2人參與
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| 最近在重組質(zhì)粒,遇上很多問題。首先就是我每次抽提質(zhì)粒的濃度總是很低。然后我那濃度低的質(zhì)粒雙酶切(Ecor1和xho1)后和目的基因連接。挑菌后菌液PCR,條帶比較弱,我擔(dān)心是假陽性,就抽提質(zhì)粒后用帶目的基因的引物做了PCR,條帶很亮,大小也對(duì)。然后雙酶切了,目的基因片段附近有點(diǎn)弱弱的條帶,我還不放心,就拿空質(zhì)粒和我認(rèn)為的重組質(zhì)粒跑了膠,一看,重組質(zhì)粒比較大,而且大小片段應(yīng)該對(duì)。。然后測(cè)序。測(cè)序結(jié)果是空質(zhì)粒。。。。。。。。。!我該怎么辦?從哪開始重做?? |
木蟲 (正式寫手)

木蟲 (正式寫手)

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1.提質(zhì)粒濃度低 有可能是你提質(zhì)粒沒提好,細(xì)胞壁沒破開,如果手提質(zhì)粒不熟練就用試劑盒吧,也有可能是你保存質(zhì)粒的菌染菌了~,接菌的培養(yǎng)基加抗性了嗎?如果在加抗性的培養(yǎng)基里搖出來的菌提質(zhì)粒還是濃度低,那就用你提出來的濃度低的質(zhì)粒用不同的宿主菌再重新轉(zhuǎn)化一下,保存質(zhì)粒的菌株是JM109還是DH5a?? 2.你用濃度很低的質(zhì)粒和基因同時(shí)雙酶切后處理了嗎,比如割膠回收或者純化??還是直接混在一起酶連了? 3.酶連后轉(zhuǎn)化,你的感受態(tài)細(xì)胞做的怎么樣?涂板的平板抗性加夠了嗎??挑出來的轉(zhuǎn)化子提質(zhì)粒濃度還低?你平板上的轉(zhuǎn)化子長(zhǎng)得怎么樣,整個(gè)平板上都是小的單菌落轉(zhuǎn)化子嗎?你從你的篩選平板上挑單菌落接試管的同時(shí)扎板保存了嗎?扎的板子上的菌落長(zhǎng)得怎么樣? 4.你用PCR來驗(yàn)證重組質(zhì)粒只能說明你的轉(zhuǎn)化子里的質(zhì)粒里含有重組質(zhì)粒,而不能證明純度,你雙酶切后目的條帶處很弱有兩個(gè)可能:一是你雙酶切處理的不徹底,就是酶切時(shí)間不夠長(zhǎng),再者就是你的質(zhì)粒不純,咱們跑的瓊脂糖凝膠是有個(gè)分辨率的,膠上看不見的不一定沒有。從測(cè)序結(jié)果上也可以看出這一點(diǎn)。~因此,你從轉(zhuǎn)化子里提的質(zhì)粒是重組質(zhì)粒和空載質(zhì)粒的混合物,~而且你的重組質(zhì)粒貌似要比空載的多一些~~ 解決的辦法很簡(jiǎn)單,就拿你從轉(zhuǎn)化子里提的質(zhì)粒重新做一下轉(zhuǎn)化,換個(gè)宿主菌做感受態(tài),以前是BL21的話可以先用個(gè)DH5a或者JM109(你一定要確認(rèn)你的菌沒有染雜菌),轉(zhuǎn)化后涂板再篩一次轉(zhuǎn)化子,一定要挑單菌落~再提一下質(zhì)?纯,如果跑的膠很亮,大小也對(duì)(想做酶切驗(yàn)證也可以),就可以送測(cè)序,轉(zhuǎn)化子就可以保存?zhèn)甘油管這樣重組質(zhì)粒就保存好了,如果想表達(dá)直接提重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化BL21就行了,順便說一句,從LZ描述的情況看,你的菌有必要做個(gè)全面篩查,我估計(jì)你保存的好多菌都不太可靠特別是BL21,實(shí)在不行就扔了問別人借一下 |

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