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木含24木蟲 (小有名氣)
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測(cè)序結(jié)果討論 已有2人參與
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1、本人測(cè)了A物種的某段序列，經(jīng)與NCBI比對(duì)，發(fā)現(xiàn)該序列與近緣物種B的某基因序列可以比對(duì)上，同源性高，但是它是與NCBI上提供的B的互補(bǔ)序列的反向序列有同源性（相同）。 我本來(lái)覺(jué)得測(cè)序公司所給的結(jié)果應(yīng)該是按照從5到3的順序排列的，可這么一來(lái)又有點(diǎn)懷疑，到底對(duì)不對(duì)？如果是這個(gè)順序，那么是不是說(shuō)明其中一個(gè)物種的染色體在該序列附近發(fā)生交換？重組？還是怎么？ 2、大家都說(shuō)說(shuō)如果拿到某物種的幾個(gè)BAC克隆全長(zhǎng)序列（每個(gè)有100多Kb），你會(huì)怎么做？怎么分析？怎么寫文章？或者接下來(lái)怎么做實(shí)驗(yàn)？等等。 |
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woshishui916
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3樓2014-01-05 14:51:51
★ ★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
gyesang: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流！ 2014-01-05 15:12:04
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
gyesang: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流！ 2014-01-05 15:12:04
| 樓主的情況剛好也是我所碰到的，我個(gè)人的觀點(diǎn)：序列對(duì)應(yīng)過(guò)來(lái)應(yīng)該是重復(fù)片段，只是兩邊的引物區(qū)不同，也就是保守區(qū)的不同，建議樓主看下同源性比對(duì)的物種所用的引物與你是否相同？應(yīng)該可以看出來(lái)問(wèn)題，至于提到的重組，交換等，沒(méi)考慮過(guò)，我也在摸索這個(gè)問(wèn)題，可以交流下 |
2樓2014-01-05 12:40:54
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4樓2014-01-06 14:38:44
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5樓2014-01-06 14:38:51
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