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木含24木蟲(chóng) (小有名氣)
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測(cè)序結(jié)果討論 已有2人參與
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1、本人測(cè)了A物種的某段序列,經(jīng)與NCBI比對(duì),發(fā)現(xiàn)該序列與近緣物種B的某基因序列可以比對(duì)上,同源性高,但是它是與NCBI上提供的B的互補(bǔ)序列的反向序列有同源性(相同)。 我本來(lái)覺(jué)得測(cè)序公司所給的結(jié)果應(yīng)該是按照從5到3的順序排列的,可這么一來(lái)又有點(diǎn)懷疑,到底對(duì)不對(duì)?如果是這個(gè)順序,那么是不是說(shuō)明其中一個(gè)物種的染色體在該序列附近發(fā)生交換?重組?還是怎么? 2、大家都說(shuō)說(shuō)如果拿到某物種的幾個(gè)BAC克隆全長(zhǎng)序列(每個(gè)有100多Kb),你會(huì)怎么做?怎么分析?怎么寫(xiě)文章?或者接下來(lái)怎么做實(shí)驗(yàn)?等等。 |
木蟲(chóng) (小有名氣)
| 樓主的情況剛好也是我所碰到的,我個(gè)人的觀點(diǎn):序列對(duì)應(yīng)過(guò)來(lái)應(yīng)該是重復(fù)片段,只是兩邊的引物區(qū)不同,也就是保守區(qū)的不同,建議樓主看下同源性比對(duì)的物種所用的引物與你是否相同?應(yīng)該可以看出來(lái)問(wèn)題,至于提到的重組,交換等,沒(méi)考慮過(guò),我也在摸索這個(gè)問(wèn)題,可以交流下 |

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
木蟲(chóng) (小有名氣)
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