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haiyanqian

木蟲 (小有名氣)

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[求助] 如何計算RMSD值已有1人參與

請問一下大家：
為了判斷對接的可靠性，有蛋白結(jié)晶的可以抽取出原來的配體再去對接，然后比較兩個結(jié)果，計算他們的RMSD值。我想請問一下，在sybylX2.0中，如何計算得到這個RMSD值呢？

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1樓 2014-01-13 15:18:00

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hongxiaoyu

銅蟲 (小有名氣)

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haiyanqian: 金幣+5, ★有幫助 2014-01-15 15:01:02

similarity在一定程度上反應(yīng)了RMSD值，小于0.8對接的結(jié)果就非常好了..

如果非要計算RMSD的話，在Application----Align Compounds-----Match 中可以一個個的比較

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2樓2014-01-14 17:54:57

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