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meatball1982銅蟲 (小有名氣)
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關(guān)于微擾對(duì)系統(tǒng)的影響
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大家好。 我有一個(gè)生物體的變化系統(tǒng)。其中的一個(gè)微擾使得系統(tǒng)向著兩個(gè)完全不同的方向發(fā)展(比如說(shuō)是A,B)。而這兩個(gè)方向A,B還是可以相互轉(zhuǎn)化的。 我覺(jué)得這個(gè)可以用混沌理論(只是大體了解)進(jìn)行研究。但具體的，要用什么數(shù)學(xué)工具，一點(diǎn)思路也沒(méi)有。 我的問(wèn)題是 1.要用混沌中的什么變量或是概念來(lái)研究我的問(wèn)題。 2.如果不用混沌理論，我應(yīng)該用哪些數(shù)學(xué)工具來(lái)進(jìn)行研究。 請(qǐng)大家給提供點(diǎn)思路�；蚴怯羞@類研究方向的先例，最好。 |
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
meatball1982: 金幣+50, ★★★很有幫助, 提供思路�？赡苄枰M(jìn)一步咨詢。 2014-01-18 10:32:43
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2樓2014-01-17 23:39:46
meatball1982
銅蟲 (小有名氣)
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我有一個(gè)蛋白質(zhì)ori，可以通過(guò)突變其中的某個(gè)氨基酸res，使ori變成A.或是通過(guò)突變另一個(gè)res變成B.而AB之間又可以通過(guò)折疊或是打開(kāi)折疊相互轉(zhuǎn)化。 老板給我講的內(nèi)容，我能理解的就是這個(gè)意思。因?yàn)榭梢酝蛔兊膔es有很多，所以我想通過(guò)將突變看成是對(duì)系統(tǒng)的一個(gè)擾動(dòng)。進(jìn)而觀察不同的res的哪些變量(就是我帖子當(dāng)中想學(xué)習(xí)的數(shù)學(xué)的變量)來(lái)分析對(duì)不同res進(jìn)行突變對(duì)整個(gè)系統(tǒng)的影響。 |
3樓2014-01-18 10:28:13
meatball1982
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4樓2014-01-18 10:33:09
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5樓2014-01-18 11:25:47
meatball1982
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6樓2014-01-20 09:24:03
meatball1982
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我有一個(gè)蛋白質(zhì)，叫pro，它是由42個(gè)氨基酸組成的，分別是res1,res2.res3,...,res42. 因?yàn)閜ro在不同的情況下，會(huì)變成proA，或是proB.而怎么改變的，我暫時(shí)（應(yīng)該是很長(zhǎng)時(shí)間之內(nèi)）不大可能知道。但我知道，如果突變其中的某一個(gè)res或是幾個(gè)res，經(jīng)過(guò)很長(zhǎng)的時(shí)間(我通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬基本是作不出來(lái)的，因?yàn)橛?jì)算資源不夠，時(shí)間又太少。)，proA會(huì)變成proB（這是一個(gè)文獻(xiàn)中說(shuō)的，是另一種pro，但這兩種pro類似。）. 于是，我的思路是， 01.首先要知道哪一個(gè)氨基酸res對(duì)這個(gè)蛋白質(zhì)pro的影響比較大。只針對(duì)這個(gè)res來(lái)深入研究。 02.在找哪個(gè)氨基酸res對(duì)蛋白質(zhì)pro影響較大時(shí)，我不知道應(yīng)該用什么數(shù)學(xué)方法。 是于，我將某個(gè)氨基酸res固定，就是不讓它突變，在正常的條件的基礎(chǔ)上，將整個(gè)蛋白質(zhì)pro作一定的改變，比如增加溫度，看蛋白質(zhì)pro整體的變化趨勢(shì)（比如能量變大變小，結(jié)構(gòu)改變多少），如果與未固定氨基酸時(shí)，增加溫度的蛋白質(zhì)的變化趨勢(shì)一致，則說(shuō)明這個(gè)氨基酸對(duì)蛋白質(zhì)的影響小。 就是在比較這兩種變化趨勢(shì)時(shí)，我遇到了問(wèn)題。因?yàn)槲业玫降氖莾蓚�(gè)情況下蛋白質(zhì)變化的軌跡，所以，我不知道我應(yīng)該用什么數(shù)學(xué)工具來(lái)進(jìn)行比較。 |
7樓2014-02-04 08:43:27
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具體的，我在網(wǎng)上找了一個(gè)軌跡（縱軸可能是我自己要的量），我自己的軌跡正在運(yùn)行，還沒(méi)完全作完。 比如兩條這樣的線，應(yīng)該如何比較。才能說(shuō)明它們相似或是不同。 |
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2014-02-04 08:48:10, 6.21 K
8樓2014-02-04 08:48:19
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9樓2014-02-18 19:28:50
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meatball1982: 金幣+20, ★★★很有幫助 2014-02-19 09:39:46
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10樓2014-02-19 00:58:03
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