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zhuimeng08

銀蟲 (正式寫手)

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在線: 276小時
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專業(yè): 藥物化學(xué)

[求助] gromacs 中的gro文件的處理

我的gro文件中 UNK只有23個原子，但是用
make_ndx  查看結(jié)果成了73個，與此同時DPP少了50個，也就是UNK末端與DPP開頭系統(tǒng)沒有很好地識別開來，怎樣才能把他們分開？
求助？？？
0 System             : 75223 atoms
  1 Protein          :  5646 atoms
  2 Protein-H          :  4411 atoms
  3 C-alpha          : 560 atoms
  4 Backbone          :  1680 atoms
  5 MainChain          :  2242 atoms
  6 MainChain+Cb       :  2764 atoms
  7 MainChain+H       :  2774 atoms
  8 SideChain          :  2872 atoms
  9 SideChain-H       :  2169 atoms
10 Prot-Masses       :  5646 atoms
11 non-Protein       : 69577 atoms
12 Other             : 25717 atoms
13 HEM                : 94 atoms
14 UNK                : 73 atoms
15 DPP                : 25550 atoms
16 Water             : 43860 atoms
17 SOL                : 43860 atoms
18 non-Water          : 31363 atoms

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1樓 2014-03-12 15:33:38

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