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lwk5716鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何確定一段序列中那一部分是啟動子 已有3人參與
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各位前輩大家好:我先一個問題感到不解,我通過抑制差減雜交獲得了一段基因的序列,并且在網(wǎng)上和其同源序列比對,發(fā)現(xiàn)開放閱讀框是拿到了,3'末端到了polyA,5'末端到了ATG之前的幾個堿基。我用那這段序列和數(shù)據(jù)庫比對找到了對應(yīng)了DNA序列,并且有了ATG前面的6Kb多的序列,但我不知道啟動子具體是哪部分,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)是哪里?請問各位前輩有沒有什么軟件或者網(wǎng)站可以預(yù)測啊?或者有沒有什么分子生物學(xué)手段進(jìn)行研究,我想知道它受哪類轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控。謝謝各位前輩了。 |
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鐵桿木蟲 (正式寫手)

專家顧問 (正式寫手)
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專家經(jīng)驗: +220 |
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你這個是經(jīng)典的啟動子mapping實驗 很簡單,你可以搞一個報告基因系統(tǒng),Luciferase、CAT、甚至來個GFP也行。 然后找一個沒有啟動子的表達(dá)載體,Luciferase系統(tǒng)的就是pGL3-Basic應(yīng)該 再把你懷疑有啟動子活性的片段裝進(jìn)去 檢測下游報告基因是否表達(dá) 用這個系統(tǒng),你可以通過不斷的做deletion,找到你這段長序列里面的核心啟動子 看看《分子克隆》第三版,有這些內(nèi)容很詳細(xì)的說明 |
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鐵桿木蟲 (正式寫手)
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