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[求助]
我需要構(gòu)建DNA和小分子作用的pdb以及top文件，遇到困難，求助 萬分感激�。�！ 已有1人參與
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我需要構(gòu)建DNA和小分子作用的pdb以及top文件，兩者合成為一個(gè)pdb好說，但是兩個(gè)合成為一個(gè)top文件遇到問題。 1. 小分子的top文件我已經(jīng)有了，但是DNA的top不知道怎么獲得，雖然VMD可以自動(dòng)生成psf文件，但是我需要它的top文件，怎么辦？ 2. 因?yàn)檫@個(gè)DNA我是處理過，刪除了一部分原子，但是在自動(dòng)生成psf的時(shí)候，它會(huì)guesscoord，會(huì)自動(dòng)補(bǔ)齊刪掉的原子，但是我只希望它補(bǔ)上氫原子而不補(bǔ)上我刪掉的部分，這個(gè)又該怎么處理？ 謝謝各位大神們，不勝感激額��！ |
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fangsteel
木蟲 (正式寫手)
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