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請教關(guān)于gromacs計算單個氨基酸殘基與配體相互作用能的問題 已有2人參與
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通過mdrun -rerun之后們可以重跑出一個新的能量文件，相信做過的都知道，我就不說了。 問題是在用g_energy 分析能量的時候，會有coul-sr LJ-sr這些項，到底應(yīng)該計算哪一個呢，比如說是精氨酸吧，帶有正電荷，是不是說我就應(yīng)該計算Coul-SR，而舍棄范德華力LJ-SR呢，而不帶電荷的那些比如，色氨酸，蘇氨酸是不是就只計算范德華力LJ，而不計算庫侖力Coul呢？ 求大神解答啊��！最近這個困擾好久了 |
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2樓2014-05-27 19:32:00
jianchen7882
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4樓2014-06-12 18:52:18
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5樓2014-06-20 15:57:01
zlf9452006
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6樓2014-06-20 22:41:01
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