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fanghongmei金蟲 (初入文壇)
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[求助]
Amber做能量最小化時(shí)輸出文件的問題
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記得以前看到過，用Amber做能量最小化時(shí)，首先進(jìn)行最陡下降法進(jìn)行計(jì)算，然后對(duì)體系進(jìn)行共軛梯度的計(jì)算，直到min.out文件中的GMAX項(xiàng)達(dá)到E-01才可以進(jìn)行下面的加熱過程。但是我不斷的增加了 最陡下降法和 共軛梯度法 的次數(shù) ，發(fā)現(xiàn)自己的體系就是達(dá)不到上述要求。所以想請教各位前輩：GMAX的具體含義是什么？為什么它需要滿足 E-01的要求呢？需要改變那些參數(shù)才能滿足上述要求？或者各位有沒有學(xué)習(xí)輸出文件的相關(guān)資料呢？ 問題有點(diǎn)多，先謝謝大家的耐心，同時(shí)也期待大家的解答！ |
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fanghongmei
金蟲 (初入文壇)
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2樓2014-07-10 08:46:17
3樓2018-11-08 14:36:09
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