 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1608 | 回復(fù): 2 | ||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
fanghongmei金蟲 (初入文壇)
|
[求助]
Amber做能量最小化時輸出文件的問題
|
|
|
記得以前看到過，用Amber做能量最小化時，首先進行最陡下降法進行計算，然后對體系進行共軛梯度的計算，直到min.out文件中的GMAX項達到E-01才可以進行下面的加熱過程。但是我不斷的增加了 最陡下降法和 共軛梯度法 的次數(shù) ，發(fā)現(xiàn)自己的體系就是達不到上述要求。所以想請教各位前輩：GMAX的具體含義是什么？為什么它需要滿足 E-01的要求呢？需要改變那些參數(shù)才能滿足上述要求？或者各位有沒有學(xué)習(xí)輸出文件的相關(guān)資料呢？ 問題有點多，先謝謝大家的耐心，同時也期待大家的解答！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)一志愿985，分數(shù)349求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑院校信息
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085600材料與化工306
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
286求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿北京化工大學(xué)070300 學(xué)碩336求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
286分人工智能專業(yè)請求調(diào)劑愿意跨考！
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
資源與環(huán)境 調(diào)劑申請(333分)
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 求助NAMD模擬后的結(jié)果如何處理
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 計算出現(xiàn)錯誤 遇到錯誤什么的最痛苦了
已經(jīng)有8人回復(fù)
- namd能量最小化完成后給我的十幾個文件怎么沒有pdb格式的呀
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 分子能量如何判斷
已經(jīng)有6人回復(fù)
- discover做能量最小化的時候總是計算失�。ㄈ鐖D1）
已經(jīng)有7人回復(fù)
- Chemdrow 3D MM2最小化能量模擬出的結(jié)構(gòu)與ROESY不符怎么辦？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- MS discover dynanic報錯
已經(jīng)有10人回復(fù)
- ms較大體系在能量最小化時算到結(jié)束突然跳出“應(yīng)用程序發(fā)生異�！钡膶υ捒�
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 用AutoDock作分子對接前的小分子能量最小化問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 為什么要進行能量最小化？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 分子能量最小化的軟件有哪些？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【分享】LAMMPS的語法中文解釋
已經(jīng)有137人回復(fù)
- 【求助】求一個gromacs的中文教程，包括安裝的部分，小弟新手，從零學(xué)起
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】用TDDFT優(yōu)化出來激發(fā)態(tài)之后的布居分析
已經(jīng)有20人回復(fù)
3樓2018-11-08 14:36:09
fanghongmei
金蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 517.3
- 帖子: 38
- 在線: 40.7小時
- 蟲號: 2850242
- 注冊: 2013-12-05
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
2樓2014-07-10 08:46:17
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料學(xué)碩301分求調(diào)劑 +7 | Liyouyumairs 2026-03-21 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑 +5 | yzysaa 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +6 | Tyoumou 2026-03-18 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +5 | 張vvvv 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | 十三加油 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +11 | 戲精丹丹丹 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 勇敢的小吳 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 余意卿 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +12 | 呼呼呼。。。。 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調(diào)劑（有工作經(jīng)驗） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 二本跨考鄭大材料306英一數(shù)二 +3 | z1z2z3879 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +7 | 司空. 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑求學(xué)校推薦 +3 | 伯樂29 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | @taotao 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 廣西大學(xué)家禽遺傳育種課題組2026年碩士招生（接收計算機專業(yè)調(diào)劑） +3 | 123阿標 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 招收博士1-2人 +3 | QGZDSYS 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081700化工學(xué)碩調(diào)劑 +3 | 【1】 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 277調(diào)劑 +5 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿，福州大學(xué)材料專碩339分求調(diào)劑 +3 | 木子momo青爭 2026-03-15 | 3/150 |
|