| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1636 | 回復(fù): 5 | ||||
qchj2004金蟲 (正式寫手)
|
[交流]
構(gòu)象搜索與能量?jī)?yōu)化有什么區(qū)別
|
| 我看計(jì)算方面的文獻(xiàn),總是對(duì)分子先進(jìn)行構(gòu)象搜索,再進(jìn)行能量?jī)?yōu)化,不懂之處:構(gòu)象搜索是計(jì)算各種構(gòu)象的能量,選取最小值,能量?jī)?yōu)化也是選取最小值,他們二者到底有什么區(qū)別了,為什么不能一次進(jìn)行完畢,非得按兩次完成? |
分子模擬 |
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
金蟲 (正式寫手)
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
木蟲 (正式寫手)
|
舉個(gè)例子你就明白了,六元烷烴環(huán)有船式和椅式兩種構(gòu)型,你去做能量?jī)?yōu)化的話,最終得到船式還是椅式,取決于你輸入進(jìn)去的初始構(gòu)型更靠近哪個(gè)。所以能量?jī)?yōu)化只能給出你一個(gè)優(yōu)化好的結(jié)構(gòu),至于是不是還存在其它構(gòu)象,它回答不了。而構(gòu)象搜索可以幫你發(fā)現(xiàn)不同的構(gòu)型,比如,一搜,發(fā)現(xiàn)了有船式和椅式兩種。那么,這兩種構(gòu)象的能量差多少,哪個(gè)更低呢?這時(shí)候需要對(duì)這種兩種構(gòu)型分別進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化,計(jì)算出其勢(shì)能,然后才能 進(jìn)行比較。 至于這個(gè)過程為什么不能一次進(jìn)行完畢,是因?yàn)槟悴涣私鈽?gòu)想搜索的方法。構(gòu)象搜索一般使用分子動(dòng)力學(xué)或者蒙特卡洛等方法進(jìn)行隨即搜索,所搜到的構(gòu)象并不處在能量最低的構(gòu)型上,必須提取出來,再做一個(gè)能量?jī)?yōu)化。 |
銀蟲 (小有名氣)
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 070303一志愿西北大學(xué)學(xué)碩310找調(diào)劑 +6 | d如愿上岸 2026-03-12 | 9/450 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑,求各位老師收留 +9 | 秋有木北 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
[考研] 085600材料與化工 +5 | 安全上岸! 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
[考研] 298-一志愿中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑 +7 | 手機(jī)用戶 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +6 | 簡(jiǎn)單點(diǎn)0 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑 +6 | 為學(xué)666 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +6 | 孔志浩 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
[考研] 070300化學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 太想進(jìn)步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | ytter 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
[考研] 277材料科學(xué)與工程080500求調(diào)劑 +3 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
[考研] 0703 物理化學(xué)調(diào)劑 +3 | 我可以上岸的對(duì)?/a> 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
[考研] 26考研一志愿中國(guó)石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +3 | 呼呼?~+123456 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
[考研] 一志愿山大07化學(xué) 332分 四六級(jí)已過 本科山東雙非 求調(diào)劑! +3 | 不想理你 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | ADT 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
[考研] 283求調(diào)劑,材料、化工皆可 +8 | 蘇打水7777 2026-03-11 | 10/500 |
|
|
[考研] 321求調(diào)劑(食品/專碩) +3 | xc321 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
[考博] 26讀博 +4 | Rui135246 2026-03-12 | 10/500 |
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +3 | 崔wj 2026-03-12 | 4/200 |
|