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killion木蟲 (小有名氣)
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[求助]
人GAPDH引物設(shè)計(jì)問題 已有2人參與
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之前都是用的現(xiàn)成的GAPDH引物,快用完了,所以想要自己設(shè)計(jì)一個(gè),但是查NCBI后發(fā)現(xiàn),人GAPDH的序列有4個(gè)不同的剪接體,那我應(yīng)該用哪個(gè)序列進(jìn)行設(shè)計(jì)呢?這是NCBI核酸庫的查詢結(jié)果:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore。還有個(gè)問題,為啥會(huì)有這么多的結(jié)果啊,是不是靠前的是最新的還是最可靠的。 QQ截圖20140805111219.jpg |
榮譽(yù)版主 (著名寫手)
一匡天下
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專家經(jīng)驗(yàn): +37 |
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都不選,選參考序列 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NG_007073.2 就是你搜索結(jié)果的第5個(gè) 一個(gè)基因可以因?yàn)閞na剪切造成多個(gè)剪接體,這是結(jié)果。但是你要是測序的話,必須測全序,然后根據(jù)全序看突變,某些突變會(huì)導(dǎo)致發(fā)生選擇性剪切。 在dna序列上,你是看不到剪接體的,只有一條含著snp的全序。只有在RNA水平上才可以看到。 他給出的剪接體是根據(jù)獲得的mRNA反推回去的 |

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