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2122346新蟲 (初入文壇)
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[求助]
功能基因克隆出現(xiàn)問題
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| 本蟲最近在做一種白腐真菌(木腐菌)的漆酶基因克隆實(shí)驗(yàn),總RNA的提取、反轉(zhuǎn)錄cDNA都應(yīng)該沒有問題,用LAC保守區(qū)的通用引物PCR也得到了想要的序列,NCBI上比對(duì)沒有問題;但是,接下來我根據(jù)近緣種的漆酶基因cDNA完整序列設(shè)計(jì)了引物,通過PCR、切膠回收、連接和轉(zhuǎn)化,選了3個(gè)陽性克隆子PCR后進(jìn)行測(cè)序,NCBI上比對(duì),結(jié)果顯示3個(gè)序列都跟漆酶相關(guān),但是3個(gè)序列不一樣,有很多位點(diǎn)差異,小弟不明白同一個(gè)基因?yàn)槭裁?個(gè)序列會(huì)這樣的不同,另外,3個(gè)序列分別與保守區(qū)序列比對(duì),也沒有對(duì)上(保守區(qū)序列沒有在全序列中),小弟對(duì)這些結(jié)果感到很迷茫,不知道是什么原因,請(qǐng)各位高手大俠給予指教。。 本人不勝感激 |
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