 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2305 | 回復(fù): 2 | ||
張永婧1991新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
高通量測序與T-RFLP的結(jié)合
|
|
本人做的是豬腸道微生物多樣性，是個新手，有很多問題需要請問大師們。 1、做T-RFLP用通用引物擴(kuò)增細(xì)菌組總DNA的保守區(qū)，然后酶切，根據(jù)片段數(shù)據(jù)庫對比找到對應(yīng)菌群，這個工作已經(jīng)完成了，但疑問是發(fā)文章用數(shù)據(jù)庫比對可靠嗎？應(yīng)該是要跟測序?qū)Ρ劝�？那么問題又來了，我看零幾年發(fā)的文章大多數(shù)就是用通用引物擴(kuò)增保守區(qū)后克隆測序，拿回來的數(shù)據(jù)再找對應(yīng)菌，這個測序是全序列測序嗎？拿回來數(shù)據(jù)能跟酶切數(shù)據(jù)比對嗎？現(xiàn)在用這個還能發(fā)好一點(diǎn)的文章嗎？ 2、導(dǎo)師想法是做個高通量測序，因?yàn)槲覀儗?shí)驗(yàn)室以前沒做過這方面的東西，弄得也是頭大。我的問題就是，高通量測序應(yīng)該測得都是可變區(qū)，得出結(jié)果后跟我酶切的保守區(qū)有什么內(nèi)在聯(lián)系呢？這兩個方法能同時聯(lián)系來說明多樣性的問題嗎？如果不做高通量，根據(jù)酶切所得的不是很可靠的結(jié)果，做定量PCR能驗(yàn)證嗎？但是做多樣性的話，定量需要定很多菌種吧？ 好多問題啊，希望大神們能給多給點(diǎn)指點(diǎn)，感覺一入分子深似海，從此畢業(yè)是路人��！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0703化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
0703化學(xué) 305求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑，求各位老師收留
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
271材料工程求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料工程專碩調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿天大材料與化工（085600）總分338
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
求材料調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 高通量測序，問一個一直以來比較困惑的問題
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 高通量測序時，針對16S rRNA, 可以測不同的V區(qū)，我們確定V區(qū)的依據(jù)是什么呢？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 高通量測序 序列分析
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 高通量測序平臺匯總
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 基因芯片和測序的區(qū)別于聯(lián)系。
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 求助宏基因組高通量測序微生態(tài)研究
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 關(guān)于454高通量測序中Singleton的去除問題？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 有誰能介紹下 當(dāng)下主要的集中高通量轉(zhuǎn)錄組測序
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 請教，有轉(zhuǎn)錄組高通量測序的得到的差異表達(dá)基因，篩選幾個基因出來進(jìn)行功能鑒定
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 常規(guī)的分子生物學(xué)技術(shù)如DGGE,T-RFLP等與高通量測序的區(qū)別
已經(jīng)有4人回復(fù)
- Illumina高通量RNA測序數(shù)據(jù)分析中不同標(biāo)準(zhǔn)化方法的綜合比較
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 高通量測序的結(jié)果怎么提交��？Sequence Read Archive (SRA)
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 454高通量測序
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 高通量測序是干什么用的？另外測序后怎樣找差異基因
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 做了個高通量測序，弱弱的問能發(fā)篇外文文章么？
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 高通量測序分析微生物物種的豐度
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 高通量測序費(fèi)用
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 求助 高通量測序
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 請問目前國內(nèi)有哪些可以做高通量測序的公司？
已經(jīng)有26人回復(fù)
- 請問高通量測序中深度和覆蓋度是什么意思？
已經(jīng)有12人回復(fù)
2樓2015-01-12 10:58:22
★
dllchina: 金幣+1, 榧撳姳浜ゆ? 2015-01-21 23:37:47
dllchina: 金幣+1, 榧撳姳浜ゆ? 2015-01-21 23:37:47
|
1、現(xiàn)在都是測序后 和數(shù)據(jù)庫在比對的 結(jié)果 2、你測序的結(jié)果也是 需要跟數(shù)據(jù)庫比對才能找到對應(yīng)的細(xì)菌種屬啊 3、高通量 用的是 保守區(qū)的引物 去擴(kuò)增可變區(qū)，你是16S rRNA測序吧 這個是擴(kuò)增子測序 相對好做一些 4、多樣性的問題 就是測序后再比對后 得到的菌群結(jié)構(gòu) 5、一般大家都是用qPCR驗(yàn)證測序結(jié)果的 只需要做幾個有差異的種屬即可 |
3樓2015-01-21 23:17:50
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 張永婧1991 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑 +4 | 守候夕陽CF 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +3 | 何潤采123 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿武理材料305分求調(diào)劑 +5 | 想上岸的鯉魚 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料/英一數(shù)二/總分289/已過A區(qū)線 +7 | 步川酷紫123 2026-03-13 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學(xué)求調(diào)劑 +6 | 薛云鵬 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 331求調(diào)劑（0703有機(jī)化學(xué) +7 | ZY-05 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +12 | 小熊joy 2026-03-14 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 085601求調(diào)劑 +4 | Du.11 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +5 | 緒幸與子 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 梁成偉老師課題組歡迎你的加入 +8 | 一鴨鴨喲 2026-03-14 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 機(jī)械專碩325，尋找調(diào)劑院校 +3 | y9999 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703一志愿211 285分求調(diào)劑 +5 | ly3471z 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | ytter 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工 323 英一+數(shù)二+物化，一志愿：哈工大 本人本科雙一流 +4 | 自由的_飛翔 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] ［0860］321分求調(diào)劑，ab區(qū)皆可 +4 | 寶貴熱 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料科學(xué)與工程/總分295/求收留 +9 | 2026調(diào)劑俠 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | 李政瑩 2026-03-12 | 3/150 |
|