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lyxdjdj新蟲 (初入文壇)
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[求助]
GLOD分子模擬結(jié)果分析和參數(shù)設(shè)置
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各位大神,本人初涉分子模擬領(lǐng)域,導(dǎo)師讓我用GLOD進行screen和dock。 以前我用過autodock進行對接,知道可以在對接完成后直接看能量數(shù)據(jù),氫鍵也可以visualize,但是請問GOLD也可以進行類似操作嗎?看GOLD的說明書感覺GOLDMine可以用來分析對接結(jié)果,但是要怎么樣才可以把數(shù)據(jù)導(dǎo)入到GOLDMine進行查看? 另外請問對接時候我導(dǎo)入的是帶有配體的蛋白分子,在delete ligand部分我extract了需要的ligand,其他的是不是默認(rèn)自動刪除的?(后期對接完成想把這個配體和后面對接上的配體作為比較) 如果大牛用過GOLD求交流~~ 謝謝。! |
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