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[求助]
求助高人幫我進行分子動力學(xué)模擬，急等�。。�
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出于工作需要，想用MD模擬分子聚集態(tài)構(gòu)象，但之前從未接觸過，因此求助高人合作。若取得滿意結(jié)果，相關(guān)文章將可掛等同一作或者第二單位通訊 大致描述一下想模擬的體系： 油酸分子在平整界面吸附形成納米尺度的domain（每個domain可以看成是一個小島，其結(jié)構(gòu)是分子單層膜），分子排布密度較大時，可以預(yù)料domain的中心位置分子烷基鏈呈現(xiàn)規(guī)整排列（類似于宏觀的langmuir膜），而在domain的邊緣位置分子排列將不那么規(guī)整，有很多gauche defects。最邊緣的分子擁有最大的自由活動空間，甚至可以趴伏在界面上；稍微往里一點的分子自由空間稍小，越往domain中心，分子自由空間越小（分子的吸附基團部分是不動的，這里的自由空間是針對分子的烷基鏈而言）。那么，這個邊緣的范圍（gauche defects較顯著的區(qū)域）到底有多大呢？雖然一個油酸分子本身的長度不過2 nm左右，但是這種邊緣效應(yīng)的范圍可能遠(yuǎn)遠(yuǎn)不止這個尺度，我目前的實驗結(jié)果顯示它可能達(dá)到幾十個納米（距離最邊緣幾十個納米的地方的分子仍然具有較大的活動空間從而產(chǎn)生較顯著的gauche defects即非規(guī)則構(gòu)象）。我想通過理論模擬來考察這一點。 體系我想一點都不復(fù)雜，有意者請站內(nèi)留言。 |
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