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cauTmac銅蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)問(wèn)題 已有1人參與
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如圖，以線粒體基因組的PCG核酸序列為data，分別用ML和BI法進(jìn)行分析，BI結(jié)果樹(shù)的置信值高（圖上沒(méi)有體現(xiàn)出來(lái)但是每個(gè)節(jié)點(diǎn)處置信值均在0.9以上），但是ML方法置信值很低。所以后面用ProtTest計(jì)算出每一個(gè)PCG蛋白序列的最佳模型，用線粒體基因組的蛋白序列再作為data用ML法分析，結(jié)果出現(xiàn)了圖3的長(zhǎng)枝吸引現(xiàn)象。想請(qǐng)教一下各位大神，首先，我前面用PCG核酸序列建樹(shù)，ML置信值低，有什么好辦法解決沒(méi)？然后就是用PCG蛋白序列建樹(shù)出現(xiàn)這種長(zhǎng)枝吸引的話有沒(méi)有什么好辦法解決？ BI.jpg ML.jpg P-ML.jpg |
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biozhajie
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2樓2015-05-07 20:08:11
cauTmac
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4樓2015-05-08 14:21:50
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