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cauTmac銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)問題 已有1人參與
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如圖，以線粒體基因組的PCG核酸序列為data，分別用ML和BI法進行分析，BI結(jié)果樹的置信值高（圖上沒有體現(xiàn)出來但是每個節(jié)點處置信值均在0.9以上），但是ML方法置信值很低。所以后面用ProtTest計算出每一個PCG蛋白序列的最佳模型，用線粒體基因組的蛋白序列再作為data用ML法分析，結(jié)果出現(xiàn)了圖3的長枝吸引現(xiàn)象。想請教一下各位大神，首先，我前面用PCG核酸序列建樹，ML置信值低，有什么好辦法解決沒？然后就是用PCG蛋白序列建樹出現(xiàn)這種長枝吸引的話有沒有什么好辦法解決？ BI.jpg ML.jpg P-ML.jpg |
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cauTmac
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4樓2015-05-08 14:21:50
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