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[交流]
初學(xué)者請教幾個(gè)關(guān)于VASP計(jì)算分子動(dòng)力學(xué)的問題
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之前一直用VASP做基礎(chǔ)的構(gòu)型優(yōu)化、表面吸附等基態(tài)性質(zhì)計(jì)算 最近開始嘗試進(jìn)行AIMD計(jì)算 主要模擬礦物表面溶劑化和離子分子水合構(gòu)型。現(xiàn)有如下幾個(gè)疑問 還望不吝賜教 1. 現(xiàn)用VASP版本為5.2.2 進(jìn)行AIMD計(jì)算需要重新編譯軟件或修改makefile文件嗎？ 2. 按照http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例輸入文件嘗試模擬了一個(gè)10倍體H2O分子簇 分別設(shè)置了1000步和3000步 一直未達(dá)到收斂 求分析（INCAR如下） 3. 針對我的主要計(jì)算內(nèi)容，VASP-AIMD的一般計(jì)算步驟是什么？數(shù)據(jù)結(jié)果分析一般如何進(jìn)行？ 多謝各位�。。� QQ截圖20150515020058.jpg |
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magicmonk
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ljw4010: 金幣+5, 謝謝指導(dǎo)解答！ 2015-05-15 20:09:37
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1. 現(xiàn)用VASP版本為5.2.2 進(jìn)行AIMD計(jì)算需要重新編譯軟件或修改makefile文件嗎？ 一般不用，除非你要用NPT系綜或其他加速動(dòng)力學(xué)方法；不過最好還是編譯一下Gamma點(diǎn)版本，因?yàn)镸D的體系一般比較大。 2. 按照http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例輸入文件嘗試模擬了一個(gè)10倍體H2O分子簇 分別設(shè)置了1000步和3000步 一直未達(dá)到收斂 求分析（INCAR如下） 未收斂是離子步未收斂還是電子步?jīng)]收斂？最好把結(jié)果文件給出來。 3. 針對我的主要計(jì)算內(nèi)容，VASP-AIMD的一般計(jì)算步驟是什么？數(shù)據(jù)結(jié)果分析一般如何進(jìn)行？ 一般步驟是先弛豫，在進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模擬。數(shù)據(jù)分析可以用VMD或者自己編一些腳本處理 |
7樓2015-05-15 08:09:34
2樓2015-05-15 02:06:26
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苦逼牛逼(金幣+2): 謝謝參與
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3樓2015-05-15 02:28:17
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